RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198		J3QR89	54 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198		K7ERJ3	54 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	CFC1B	P0CG36	223 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	CFC1	P0CG37	223 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	IFITM1	P13164	125 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	LITAF	Q99732	161 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	NDUFA1	O15239	70 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	HERVK_113	P63121	156 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	COPS9	Q8WXC6	57 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	SCGB1A1	P11684	91 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	UBE2B	P63146	152 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198		A4D1N5	150 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	C2orf82	Q6UX34	121 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	VPS25	Q9BRG1	176 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	C22orf24	Q9Y442	160 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM4B-208	ENST00000534198	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	PCP4	P48539	62 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	HERV-K104	P63124	156 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	TPRXL	Q17RH7	258 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	ERG28	Q9UKR5	140 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	CRYGA	P11844	174 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	SFTA2	Q6UW10	78 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	TEN1	Q86WV5	123 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	TCL1B	O95988	128 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	CDIP1	Q9H305	208 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	BCE1	O60756	84 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	PSMB2	P49721	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198		H3BT86	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	COX6C	P09669	75 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM4B-208	ENST00000534198	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC25A20	O43772	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	LST1	O00453	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIAP1	O43715	76 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	PRSS2	P07478	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	TRAC	P01848	142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198		C9JAW5	83 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198		Q8IZM0	81 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	CKS1B	P61024	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198		Q1RN00	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM4B-208	ENST00000534198	CXCL5	P42830	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM4B-208	ENST00000534198	COX17	Q14061	63 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM4B-208	ENST00000534198		Q6Q795	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM4B-208	ENST00000534198	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM4B-208	ENST00000534198	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM4B-208	ENST00000534198	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM4B-208	ENST00000534198		H0YGX0	51 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM4B-208	ENST00000534198	ACYP1	P07311	99 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM4B-208	ENST00000534198		A0A1B0GX51	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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