RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384276.1

RNU6-611P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 611, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-611P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-611P-201ENST00000384276 NCOA2Q15596 1464 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 KIF20BQ96Q89 1820 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 AKAP13Q12802 2813 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 CLIP1P30622 1438 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 ADIRFQ15847 76 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 S100A13Q99584 98 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 ERVK-7P63135 1459 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 H3BUT2 72 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 CCL22O00626 93 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 SPRR2DP22532 72 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 QSER1Q2KHR3 1735 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 STAB1Q9NY15 2570 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 WFDC13Q8IUB5 93 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 PREX1Q8TCU6 1659 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 BCORQ6W2J9 1755 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 UBR3Q6ZT12 1888 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 RPL38P63173 70 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 PIK3C2BO00750 1634 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 NBASA2RRP1 2371 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 LRP1BQ9NZR2 4599 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 M0R2T5 61 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 NDUFB1O75438 58 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 NDUFA3O95167 84 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 IFI6P09912 130 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 STAB2Q8WWQ8 2551 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 DOT1LQ8TEK3 1739 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 COL6A3P12111 3177 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-611P-201ENST00000384276 PKHD1P08F94 4074 aa0.03□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 PCNX1Q96RV3 2341 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 A0A087WXM4 84 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 SMIM13P0DJ93 91 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 DEFB121Q5J5C9 76 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 KDM5DQ9BY66 1539 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 LTN1O94822 1766 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 UMAD1C9J7I0 102 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 SSPOA2VEC9 5147 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 ZANQ9Y493 2812 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 DSPP15924 2871 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 NREPQ16612 68 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 DEFB135Q30KP9 77 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 NWD1Q149M9 1564 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 ABCC1P33527 1531 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 RGPD5Q99666 1765 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 NDUFA4O00483 81 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 DEFA5Q01523 94 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 C18orf32Q8TCD1 76 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 TGP01266 2768 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 SCRIBQ14160 1630 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 LYSTQ99698 3801 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 C4AP0C0L4 1744 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 C4BP0C0L5 1744 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 LCE6AA0A183 80 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 NESP48681 1621 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-611P-201ENST00000384276 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-611P-201ENST00000384276 PKD1P98161 4303 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-611P-201ENST00000384276 SPRR2BP35325 72 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-611P-201ENST00000384276 ADAMTS12P58397 1594 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-611P-201ENST00000384276 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-611P-201ENST00000384276 CD163L1Q9NR16 1453 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-611P-201ENST00000384276 MUC2Q02817 5179 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-611P-201ENST00000384276 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-611P-201ENST00000384276 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-611P-201ENST00000384276 CEP290O15078 2479 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-611P-201ENST00000384276 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-611P-201ENST00000384276 ABCA8O94911 1581 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-611P-201ENST00000384276 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-611P-201ENST00000384276 NF1P21359 2839 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms