RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00032P0C843 101 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGLC2P0DOY2 106 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGLC3P0DOY3 106 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 ETDBQ3ZM63 59 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 MT-ATP8P03928 68 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 S100PP25815 95 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 COL12A1Q99715 3063 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 MUC17Q685J3 4493 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYH4Q9Y623 1939 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 LAMA1P25391 3075 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 CUBNO60494 3623 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 F8WEM9 126 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 MT1AP04731 61 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 S100A10P60903 97 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPRR2FQ96RM1 72 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAUP35544 74 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPY30Q9C005 99 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 QSER1Q2KHR3 1735 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 TEX14Q8IWB6 1497 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 RGPD5Q99666 1765 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGI2Q86UL8 1455 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 COX7BP24311 80 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 KALRNO60229 2985 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 C14orf144Q96I85 54 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 COL6A5A8TX70 2615 aa-0.85□□□□□ -2.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACBD7Q8N6N7 88 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 PREX1Q8TCU6 1659 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 NBEAQ8NFP9 2946 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACACAQ13085 2346 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTORP42345 2549 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 C9orf92A6NGG3 77 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 H3BNG1 76 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBP2P50120 134 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMIM11AP58511 58 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAH11Q96DT5 4516 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRK2Q5S007 2527 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1B0GUT8 65 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFA3O95167 84 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 FANCAO15360 1455 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAFA1Q96PS6 74 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLGLAQ15195 96 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP10BO94823 1461 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 C4AP0C0L4 1744 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 C4BP0C0L5 1744 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALKQ9UM73 1620 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 IQCF6A8MYZ5 107 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYB5AP00167 134 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 PEA15Q15121 130 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC7Q96NW7 1537 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM186AA6NE01 2351 aa-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 C3orf79P0CE67 100 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-78P-201ENST00000362897 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-78P-201ENST00000362897 M0R143 59 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-78P-201ENST00000362897 GYPAP02724 150 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-78P-201ENST00000362897 NCMAPQ5T1S8 102 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP7BP35670 1465 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRO3102Q9H379 93 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-78P-201ENST00000362897 RGPD1P0DJD0 1748 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-78P-201ENST00000362897 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-0.94□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms