RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000100497.10

Actb-201, Transcript of Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Actb, Length 1,920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Axon, Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Dendrite, Endoplasmic reticulum, Exosome, Growth cone, Lamellipodium, Perinuclear, Ribosome, Somatodendritic compartment .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm12886B1AZM5 119 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm9925F6T2U3 160 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Myod1P10085 318 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Saa4P31532 130 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Arl14eplQ3UKZ7 152 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Mob4Q6PEB6 225 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Dppa1Q810Y7 116 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Tmem91Q8C581 172 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Ramp1Q9WTJ5 148 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Trav6d-7A0A075B6B0 112 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Vmn1r119E9Q4H3 307 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 SeboxP70368 190 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 SlpiP97430 131 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 BC100530Q497J0 97 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 IqcjQ8BPW0 110 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Prelid1Q8R107 217 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Gpr87Q99MT7 358 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Atp6v0e1Q9CQD8 81 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Muc5acE9QAQ8 3455 aa9.62□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Zzef1Q5SSH7 2924 aa9.61□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Cspg4Q8VHY0 2327 aa9.61□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Ighv6-3A0A075B5T2 118 aa9.61□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Trav9-1A0A075B601 112 aa9.61□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Vmn1r232A2RTT5 351 aa9.61□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Itgb1bp1O35671 200 aa9.61□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Reg1P43137 165 aa9.61□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 NdpP48744 131 aa9.61□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 SeleQ00690 612 aa9.61□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 AsipQ03288 131 aa9.61□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Cd52Q64389 74 aa9.61□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Jpt2Q6PGH2 190 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr873Q8VFJ0 319 aa9.61□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Slc25a39Q9D8K8 359 aa9.61□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 AcanQ61282 2132 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Tdgf1P51865 171 aa9.6□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm10842Q3U587 122 aa9.6□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Megf10Q6DIB5 1147 aa9.6□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Znf329Q6GQR8 522 aa9.6□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Mrpl33Q9CQP0 65 aa9.6□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Chchd5Q9CQP3 110 aa9.6□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Nudt3Q9JI46 168 aa9.6□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Gnb4P29387 340 aa9.6□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Siah2Q06986 325 aa9.6□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Vwc2lQ505H4 222 aa9.6□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Onecut2Q6XBJ3 505 aa9.6□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr823Q7TRH2 315 aa9.6□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr824Q8VFU4 315 aa9.6□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 SmagpQ99KC7 97 aa9.6□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 MNCb-2875Q9DCB3 74 aa9.6□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Obox8V9GWY9 217 aa9.6□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Tcrg-V6A0A075B5Y8 134 aa9.59□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 KprpB2RUR4 657 aa9.59□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm17455G3UW87 128 aa9.59□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 RhogP84096 191 aa9.59□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Slc35b1P97858 322 aa9.59□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Pex7P97865 318 aa9.59□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Znf641Q8BZ34 422 aa9.59□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Golt1bQ9CR60 138 aa9.59□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Ptpn13Q64512 2453 aa9.59□□□□□ -0.87
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm33815A0A087WNV3 176 aa9.58□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm29644A0A087WPG2 191 aa9.58□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm21983D6RFS9 131 aa9.58□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm5218F6YH22 154 aa9.58□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Cd3eP22646 189 aa9.58□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Rps20P60867 119 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr904Q7TRC9 310 aa9.58□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr981Q8VEU2 310 aa9.58□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Igkv4-90A0A075B5L3 117 aa9.58□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm4565A0A140LJ87 301 aa9.58□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Shisal2aA2A9G7 189 aa9.58□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm5878E9PUB3 99 aa9.58□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Ceacam11Q9D0Z8 303 aa9.58□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Znf580Q9DB38 172 aa9.58□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Tmem141A2AJB2 108 aa9.57□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Adrb3P25962 400 aa9.57□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Hist1h1tQ07133 208 aa9.57□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm94Q3V2D2 93 aa9.57□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Il31Q6EAL8 163 aa9.57□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr975Q8VG91 310 aa9.57□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Tmem208Q9CR96 173 aa9.57□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Rhox7bA6PW38 321 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Obox7Q4KL20 218 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Tnfsf15Q5UBV8 252 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Srsf2Q62093 221 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Srsf1Q6PDM2 248 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Hif1anQ8BLR9 349 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1339Q8VGB1 315 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Cml3Q9JIY8 226 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Zfp53Q9Z117 652 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Ms4a12A0A087WSB9 263 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Fndc10A2A9Q0 223 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Plcxd2B2RXA1 340 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Zfp493E9Q1L8 384 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm9964E9Q9S5 144 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1185-ps1F6XP16 303 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm15292L7N231 93 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Defa26Q3L180 93 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 AW146154Q3TPQ7 468 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Psg25Q497W1 475 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Arl11Q6P3A9 176 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 76.5 ms