Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Saa4P31532 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,89■■□□□ 1,74
Saa4P31532 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Saa4P31532 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Saa4P31532 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,73■■□□□ 1,55
Saa4P31532 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Saa4P31532 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Saa4P31532 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Saa4P31532 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Saa4P31532 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Saa4P31532 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Saa4P31532 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Saa4P31532 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Saa4P31532 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Saa4P31532 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,41■■□□□ 1,34
Saa4P31532 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,39■■□□□ 1,33
Saa4P31532 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Saa4P31532 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Saa4P31532 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Saa4P31532 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Saa4P31532 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Saa4P31532 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,01■■□□□ 1,27
Saa4P31532 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Saa4P31532 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Saa4P31532 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Saa4P31532 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Saa4P31532 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Saa4P31532 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Saa4P31532 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,64■■□□□ 1,21
Saa4P31532 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Saa4P31532 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Saa4P31532 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,2
Saa4P31532 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,57■■□□□ 1,2
Saa4P31532 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,56■■□□□ 1,2
Saa4P31532 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Saa4P31532 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Saa4P31532 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,36■■□□□ 1,17
Saa4P31532 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Saa4P31532 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Saa4P31532 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Saa4P31532 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Saa4P31532 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,21■■□□□ 1,15
Saa4P31532 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Saa4P31532 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Saa4P31532 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,1■■□□□ 1,13
Saa4P31532 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Saa4P31532 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,08■■□□□ 1,13
Saa4P31532 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Saa4P31532 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Saa4P31532 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Saa4P31532 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Saa4P31532 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Saa4P31532 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Saa4P31532 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Saa4P31532 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Saa4P31532 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Saa4P31532 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Saa4P31532 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,74■■□□□ 1,07
Saa4P31532 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Saa4P31532 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Saa4P31532 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,67■■□□□ 1,06
Saa4P31532 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Saa4P31532 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Saa4P31532 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Saa4P31532 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Saa4P31532 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Saa4P31532 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Saa4P31532 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,03
Saa4P31532 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21,49■■□□□ 1,03
Saa4P31532 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Saa4P31532 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Saa4P31532 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Saa4P31532 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Saa4P31532 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Saa4P31532 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Saa4P31532 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Saa4P31532 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Saa4P31532 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,31■■□□□ 1
Saa4P31532 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,29■■□□□ 1
Saa4P31532 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Saa4P31532 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Saa4P31532 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,99
Saa4P31532 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Saa4P31532 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Saa4P31532 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Saa4P31532 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Saa4P31532 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Saa4P31532 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Saa4P31532 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Saa4P31532 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Saa4P31532 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0,95
Saa4P31532 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Saa4P31532 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Saa4P31532 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Saa4P31532 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Saa4P31532 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Saa4P31532 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Saa4P31532 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Saa4P31532 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Saa4P31532 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms