RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smug1Q6P5C5 279 aa9.07□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem177Q8BPE4 311 aa9.07□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Derl1Q99J56 251 aa9.07□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm21900J3QP38 180 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc35d2Q762D5 326 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cml1Q9JIZ0 222 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tcte2E9PY37 120 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10553J3QPF1 123 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10190Q8BSD7 107 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1228Q8VGM9 323 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vamp5Q9Z2P8 102 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm21616B6ZB74 166 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr779E9PUS9 130 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr715bE9Q725 315 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 CrygbP04344 175 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1246Q7TQZ6 314 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr715Q8VG49 315 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 3110018I06RikQ9CXS0 120 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wfdc15bQ9JHY4 80 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnip3Q9QXT8 256 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bub3Q9WVA3 326 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm27027S4R1M6 97 aa9.06□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igkv4-71A0A0G2JEH0 117 aa9.05□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2al1jA2BFR3 109 aa9.05□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm7849D3YX03 116 aa9.05□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp983E9PUT0 460 aa9.05□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 MsmbO08540 113 aa9.05□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trpt1Q8K3A2 249 aa9.05□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1440Q8VFV4 315 aa9.05□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mcrip2Q9CQB2 160 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dynlrb2Q9DAJ5 96 aa9.05□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igkv4-90A0A075B5L3 117 aa9.05□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr709-ps1A0A140T8J9 307 aa9.05□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ebi3O35228 228 aa9.05□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fli1P26323 452 aa9.05□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stxbp6Q8R3T5 210 aa9.05□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr33Q8VGX7 318 aa9.05□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rbmxl1Q91VM5 388 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm28372A0A087WNV0 220 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trbv3A0A0A6YYE2 117 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1185-ps1F6XP16 303 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tac3P55099 116 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Crisp3Q03402 241 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5150Q1AN92 299 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 OpalinQ7M750 143 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5741B2RVA4 72 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Irf2bp2E9Q1P8 570 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5849J3QPE5 117 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 SbsponQ3UPR9 264 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Glrx5Q80Y14 152 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 UrahQ9CRB3 118 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 AhspQ9CY02 102 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fxyd4Q9D2W0 88 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lyg1Q9D7Q0 197 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmprss5Q9ER04 455 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 9530053A07RikE9PVG8 2581 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hoxd3P09027 433 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tppp2Q0P5Y3 170 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp6v0bQ91V37 205 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ube2e2Q91W82 201 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 SNORCQ9CXL7 121 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fbxo25Q9D2Y6 357 aa9.04□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv1-80A0A075B5Y3 117 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp825A0A1Y7VK00 292 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm6871L7N248 545 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q3UUX7 111 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem91Q8C581 172 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Avpi1Q9D7H4 142 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tnfrsf13cQ9D8D0 175 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r63Q9EPT1 300 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dazap1Q9JII5 406 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mettl23A2AA28 253 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 B430305J03RikQ8BQQ8 176 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tomm40Q9QYA2 361 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp979A2A799 407 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr235E9Q9Z6 312 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mgst1Q91VS7 155 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ufc1Q9CR09 167 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spcs1Q9D958 161 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spaca3Q9D9X8 221 aa9.03□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc25a29Q8BL03 306 aa9.02□□□□□ -0.96
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv8-2A0A0A6YW58 119 aa9.02□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm6970F7DCP6 221 aa9.02□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q4KKZ1 196 aa9.02□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arl11Q6P3A9 176 aa9.02□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pde6hP61249 83 aa9.02□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rps10P63325 165 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smim9Q3V0X1 137 aa9.02□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ifna11Q61716 190 aa9.02□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bpifb3Q80ZU7 473 aa9.02□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trbv17A0A140T8P8 114 aa9.01□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sfrp2P97299 295 aa9.01□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dpm3Q9D1Q4 92 aa9.01□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Shisal2aA2A9G7 189 aa9.01□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm21983D6RFS9 131 aa9.01□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Brwd1Q921C3 2304 aa9.01□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv1-15A0A0A6YXA5 117 aa9.01□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnase1P00683 149 aa9.01□□□□□ -0.97
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gstp2P46425 210 aa9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.4 ms