Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y6

Fbxo25, F-box only protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo25Q9D2Y6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Fbxo25Q9D2Y6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fbxo25Q9D2Y6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fbxo25Q9D2Y6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fbxo25Q9D2Y6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Fbxo25Q9D2Y6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fbxo25Q9D2Y6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fbxo25Q9D2Y6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fbxo25Q9D2Y6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbxo25Q9D2Y6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbxo25Q9D2Y6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbxo25Q9D2Y6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo25Q9D2Y6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbxo25Q9D2Y6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fbxo25Q9D2Y6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fbxo25Q9D2Y6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo25Q9D2Y6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxo25Q9D2Y6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo25Q9D2Y6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo25Q9D2Y6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo25Q9D2Y6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo25Q9D2Y6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo25Q9D2Y6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo25Q9D2Y6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo25Q9D2Y6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxo25Q9D2Y6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo25Q9D2Y6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo25Q9D2Y6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fbxo25Q9D2Y6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo25Q9D2Y6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fbxo25Q9D2Y6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo25Q9D2Y6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo25Q9D2Y6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbxo25Q9D2Y6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fbxo25Q9D2Y6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbxo25Q9D2Y6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fbxo25Q9D2Y6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fbxo25Q9D2Y6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fbxo25Q9D2Y6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo25Q9D2Y6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo25Q9D2Y6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo25Q9D2Y6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo25Q9D2Y6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo25Q9D2Y6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo25Q9D2Y6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo25Q9D2Y6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo25Q9D2Y6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo25Q9D2Y6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo25Q9D2Y6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fbxo25Q9D2Y6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo25Q9D2Y6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo25Q9D2Y6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo25Q9D2Y6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo25Q9D2Y6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbxo25Q9D2Y6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbxo25Q9D2Y6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo25Q9D2Y6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo25Q9D2Y6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo25Q9D2Y6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo25Q9D2Y6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo25Q9D2Y6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo25Q9D2Y6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo25Q9D2Y6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo25Q9D2Y6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo25Q9D2Y6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo25Q9D2Y6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo25Q9D2Y6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo25Q9D2Y6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo25Q9D2Y6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo25Q9D2Y6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo25Q9D2Y6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo25Q9D2Y6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo25Q9D2Y6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo25Q9D2Y6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo25Q9D2Y6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo25Q9D2Y6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo25Q9D2Y6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo25Q9D2Y6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo25Q9D2Y6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo25Q9D2Y6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo25Q9D2Y6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo25Q9D2Y6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo25Q9D2Y6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo25Q9D2Y6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo25Q9D2Y6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo25Q9D2Y6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo25Q9D2Y6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo25Q9D2Y6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo25Q9D2Y6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo25Q9D2Y6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo25Q9D2Y6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo25Q9D2Y6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo25Q9D2Y6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo25Q9D2Y6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo25Q9D2Y6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo25Q9D2Y6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo25Q9D2Y6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo25Q9D2Y6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo25Q9D2Y6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo25Q9D2Y6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms