RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553843.5

RHOXF1-AS1-201, RHOXF1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RHOXF1-AS1, Length 2,102 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.39□□□□□ -1.55
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RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 REG3AQ06141 175 aa5.38□□□□□ -1.55
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RNF151Q2KHN1 245 aa5.38□□□□□ -1.55
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ETDBQ3ZM63 59 aa5.38□□□□□ -1.55
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.38□□□□□ -1.55
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.38□□□□□ -1.55
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RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
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RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.36□□□□□ -1.55
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RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PRR34Q9NV39 138 aa5.36□□□□□ -1.55
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RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.34□□□□□ -1.55
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.33□□□□□ -1.56
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RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C2orf82Q6UX34 121 aa5.33□□□□□ -1.56
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TEN1Q86WV5 123 aa5.33□□□□□ -1.56
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.32□□□□□ -1.56
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RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 USP17L23D6RBM5 183 aa5.32□□□□□ -1.56
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RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 IGKV2D-28P01615 120 aa5.32□□□□□ -1.56
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RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HERC2O95714 4834 aa5.29□□□□□ -1.56
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HAMPP81172 84 aa5.29□□□□□ -1.56
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RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.27□□□□□ -1.57
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RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C15orf56Q8N910 161 aa5.27□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.27□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HSPG2P98160 4391 aa5.26□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.26□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.26□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 XGP55808 180 aa5.26□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.26□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.25□□□□□ -1.57
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RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.25□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PCP4P48539 62 aa5.24□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.24□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.24□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.24□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SLPIP03973 132 aa5.23□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SIGMAR1Q99720 223 aa5.23□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TMEM126AQ9H061 195 aa5.23□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CDIP1Q9H305 208 aa5.23□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.23□□□□□ -1.57
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 Q8NDZ9 215 aa5.23□□□□□ -1.57
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