RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478804.3

MBD5-208, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 5, human

TSL 5

Gene MBD5, Length 592 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MBD5-208	ENST00000478804	ABCA3	Q99758	1704 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MBD5-208	ENST00000478804	ERVK-7	P63135	1459 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MBD5-208	ENST00000478804	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MBD5-208	ENST00000478804	AKAP12	Q02952	1782 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MBD5-208	ENST00000478804	POLQ	O75417	2590 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MBD5-208	ENST00000478804	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MBD5-208	ENST00000478804	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MBD5-208	ENST00000478804	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
MBD5-208	ENST00000478804	MED14	O60244	1454 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MBD5-208	ENST00000478804	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MBD5-208	ENST00000478804	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MBD5-208	ENST00000478804	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
MBD5-208	ENST00000478804	CACNA1C	Q13936	2221 aa		0.34	□□□□□ -2.35
MBD5-208	ENST00000478804	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		0.34	□□□□□ -2.35
MBD5-208	ENST00000478804	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		0.34	□□□□□ -2.35
MBD5-208	ENST00000478804	NDUFA4	O00483	81 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	IFI6	P09912	130 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	KLK9	Q2XQG4	91 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	PRO3102	Q9H379	93 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	MDN1	Q9NU22	5596 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	KIAA0556	O60303	1618 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	SHROOM2	Q13796	1616 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	KIF14	Q15058	1648 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	IGF2R	P11717	2491 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	SMIM5	Q71RC9	77 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	S100Z	Q8WXG8	99 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	PAPPA	Q13219	1627 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	SCRIB	Q14160	1630 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	NCOA2	Q15596	1464 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	BTAF1	O14981	1849 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	SPTA1	P02549	2419 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	HFM1	A2PYH4	1435 aa		0.32	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		0.32	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		0.32	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	NDUFA3	O95167	84 aa		0.32	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	LINC00158	P58513	81 aa		0.32	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		0.32	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	CHD1	O14646	1710 aa		0.32	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		0.32	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	UTRN	P46939	3433 aa		0.32	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	USF3	Q68DE3	2245 aa		0.32	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		0.31	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		0.31	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		0.31	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		0.31	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		0.31	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	C5	P01031	1676 aa		0.31	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	SCN7A	Q01118	1682 aa		0.31	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		0.31	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		0.31	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		0.31	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	SERF2	P84101	59 aa		0.31	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		0.31	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	ENHO	Q6UWT2	76 aa		0.31	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		0.31	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		0.31	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	COL4A6	Q14031	1691 aa		0.3	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		0.3	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		0.3	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		0.3	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		0.3	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		0.3	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804		M0R2T5	61 aa		0.3	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	DEFB135	Q30KP9	77 aa		0.3	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	ZNF292	O60281	2723 aa		0.29	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		0.29	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		0.29	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	PCNT	O95613	3336 aa		0.29	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	ZFHX3	Q15911	3703 aa		0.29	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	NMES1	Q9C002	83 aa		0.29	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		0.29	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	SHPRH	Q149N8	1683 aa		0.29	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		0.29	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	BRCA2	P51587	3418 aa		0.29	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	SLIT1	O75093	1534 aa		0.28	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		0.28	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		0.28	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804		A0A087WWC5	75 aa		0.28	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	FCER1G	P30273	86 aa		0.28	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	LAMA3	Q16787	3333 aa		0.28	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	0.28	□□□□□ -2.36
MBD5-208	ENST00000478804	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		0.28	□□□□□ -2.36

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