RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 A0A1B0GX51 115 aa6.34□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.33□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 OXTP01178 125 aa6.33□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 LEPROTO15243 131 aa6.33□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 UBE2D1P51668 147 aa6.33□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.33□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.33□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 RTL8CO15255 209 aa6.33□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 COX6CP09669 75 aa6.33□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.33□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 UPK3BQ9BT76 320 aa6.33□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 COX6A2Q02221 97 aa6.32□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.32□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.32□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 GAS8-AS1O95177 125 aa6.32□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 Q9UF83 564 aa6.31□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 UQCRQO14949 82 aa6.3□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 Q5XG85 94 aa6.3□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 GHRHP01286 108 aa6.3□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.3□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.3□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.3□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 A0A087WTM6 91 aa6.29□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 PMAIP1Q13794 54 aa6.29□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 TENM3Q9P273 2699 aa6.29□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 DNAL4O96015 105 aa6.29□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 CFC1BP0CG36 223 aa6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 CFC1P0CG37 223 aa6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 TNP2Q05952 138 aa6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 Q8N3U1 123 aa6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 TGP01266 2768 aa6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 FBN3Q75N90 2809 aa6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 F8WEM9 126 aa6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 C11orf86A6NJI1 115 aa6.27□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 C2orf82Q6UX34 121 aa6.27□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF575Q86XF7 245 aa6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 J3QL48 77 aa6.25□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 LINC01620Q4KN68 170 aa6.25□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.25□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.25□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 ENHOQ6UWT2 76 aa6.25□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.25□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.25□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 COX7CP15954 63 aa6.24□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 Q8IZM0 81 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 NDUFC2O95298 119 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 CRYGAP11844 174 aa6.22□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.22□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.22□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.22□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 ATXN8Q156A1 80 aa6.22□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 Q8N814 137 aa6.22□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
DDX39B-215ENST00000462256 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 Q6ZRU5 148 aa6.21□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 EPM2AB3EWF7 344 aa6.21□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.21□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 VWFP04275 2813 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 TENM2Q9NT68 2774 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 IGIPA6NJ69 53 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 NCR3O14931 201 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 C1orf137Q5JT78 98 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 IMUPQ9GZP8 106 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 DAND5Q8N907 189 aa6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 TIMM17BO60830 172 aa6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM258P61165 79 aa6.18□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 C20orf197Q8N268 126 aa6.18□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.18□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 IGKV2D-28P01615 120 aa6.18□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 HAMPP81172 84 aa6.18□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 A0A087WVE0 104 aa6.17□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 TRIAP1O43715 76 aa6.17□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.17□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 PRR34Q9NV39 138 aa6.17□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 SPANXCQ9NY87 97 aa6.17□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.17□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.17□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.16□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.16□□□□□ -1.42
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