RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 B5MCH6 92 aa2.69□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 C6orf223Q8N319 242 aa2.69□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV10A0A0B4J240 114 aa2.68□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 C9JAW5 83 aa2.68□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 SPAG11BQ08648 103 aa2.68□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa2.68□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 ATXN8Q156A1 80 aa2.68□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa2.68□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 CLEC2BQ92478 149 aa2.68□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 CXCL5P42830 114 aa2.68□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 C10orf25Q5T742 122 aa2.68□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00337Q8N6G1 96 aa2.68□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa2.67□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.67□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV2D-28P01615 120 aa2.67□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC01620Q4KN68 170 aa2.67□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 OR13C6PQ8NH95 151 aa2.67□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa2.67□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A20O43772 301 aa2.67□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 Q9HAA7 133 aa2.67□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 PRR3P79522 188 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 HIGD2BQ4VC39 106 aa2.67□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC01556Q5JQF7 62 aa2.67□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 C15orf53Q8NAA6 179 aa2.67□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 PPDPFQ9H3Y8 114 aa2.67□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 COX17Q14061 63 aa2.66□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00588Q9Y4M8 146 aa2.66□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0U1RQV1 116 aa2.66□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 LST1O00453 97 aa2.66□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 STAB2Q8WWQ8 2551 aa2.66□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 J3QR89 54 aa2.66□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa2.66□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 TEN1Q86WV5 123 aa2.66□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.66□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 SMIM11BQ8TCY0 68 aa2.66□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.65□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 CAMK2N2Q96S95 79 aa2.65□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAH10OSP0CZ25 163 aa2.65□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL28P46779 137 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 CARD19Q96LW7 228 aa2.65□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 C6orf48Q9UBA6 75 aa2.65□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 C15orf56Q8N910 161 aa2.64□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 PPDPFLQ8WWR9 84 aa2.64□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM218AQ96MZ4 157 aa2.64□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 XAGE1AQ9HD64 81 aa2.64□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 NCR3O14931 201 aa2.64□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZRU5 148 aa2.64□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 Q8NDZ9 215 aa2.64□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 B9D2Q9BPU9 175 aa2.64□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 COL7A1Q02388 2944 aa2.64□□□□□ -1.99
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LRRTM4-201ENST00000409088 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa2.63□□□□□ -1.99
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LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM126AQ9H061 195 aa2.63□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A087WYN8 130 aa2.63□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 H0YGX0 51 aa2.63□□□□□ -1.99
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LRRTM4-201ENST00000409088 C2orf48Q96LS8 159 aa2.63□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 GAGE2DQ9UEU5 116 aa2.63□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 LECT2O14960 151 aa2.62□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAL4O96015 105 aa2.62□□□□□ -1.99
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LRRTM4-201ENST00000409088 SYCNQ0VAF6 134 aa2.62□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa2.62□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 MUC7Q8TAX7 377 aa2.62□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa2.62□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L23D6RBM5 183 aa2.62□□□□□ -1.99
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LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa2.61□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZRP5 223 aa2.61□□□□□ -1.99
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LRRTM4-201ENST00000409088 APLNQ9ULZ1 77 aa2.61□□□□□ -1.99
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LRRTM4-201ENST00000409088 TENM2Q9NT68 2774 aa2.61□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa2.61□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa2.6□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM236CP0DP71 79 aa2.6□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa2.6□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 DNHD1Q96M86 4753 aa2.6□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLV6-57P01721 117 aa2.6□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 XGP55808 180 aa2.6□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 C4orf26Q17RF5 130 aa2.6□□□□□ -1.99
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00476Q8WZB0 136 aa2.6□□□□□ -1.99
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