RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 A0A0U1RQV1 116 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 EPM2AB3EWF7 344 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00313P59037 77 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 PRR4Q16378 134 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 PRO0628Q9UI54 55 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-201ENST00000261266 PCOTHQ58A44 107 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 ABCA1O95477 2261 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 PMAIP1Q13794 54 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1B0GU69 56 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 PIEZO1Q92508 2521 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 NBASA2RRP1 2371 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 LINC01600Q96MT4 127 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRB-201ENST00000261266 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRB-201ENST00000261266 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRB-201ENST00000261266 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6□□□□□ -1.45
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV2-30P06310 120 aa6□□□□□ -1.45
PTPRB-201ENST00000261266 DEFB116Q30KQ4 102 aa6□□□□□ -1.45
PTPRB-201ENST00000261266 C15orf56Q8N910 161 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRB-201ENST00000261266 TNCP24821 2201 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRB-201ENST00000261266 PSPHP1O15172 72 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRB-201ENST00000261266 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRB-201ENST00000261266 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF861PO60384 105 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRB-201ENST00000261266 CD164Q04900 197 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRB-201ENST00000261266 KLKP1Q107X0 134 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRB-201ENST00000261266 PRR15Q8IV56 129 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRB-201ENST00000261266 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1B0GVX0 72 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 WIPF1O43516 503 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP10-11P60412 298 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 ATRXP46100 2492 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 IGFL1Q6UW32 110 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 K7EIL1 84 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 SPINK1P00995 79 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 Q9UF83 564 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF575Q86XF7 245 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 MED13LQ71F56 2210 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRB-201ENST00000261266 Q96NJ1 140 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRB-201ENST00000261266 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 AGRNO00468 2067 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 CACNA1AO00555 2505 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 K7EQZ3 153 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 COA5Q86WW8 74 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP10-3P60369 221 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 Q8N377 158 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV7-43P04211 117 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRB-201ENST00000261266 SPRR4Q96PI1 79 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRB-201ENST00000261266 FAM168BA1KXE4 195 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-201ENST00000261266 UQCR11O14957 56 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-201ENST00000261266 FAM104AQ969W3 186 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRB-201ENST00000261266 CHTF8P0CG12 524 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-201ENST00000261266 DSCAML1Q8TD84 2053 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-201ENST00000261266 NOTCH3Q9UM47 2321 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-201ENST00000261266 SPG11Q96JI7 2443 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRB-201ENST00000261266 BDP1A6H8Y1 2624 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRB-201ENST00000261266 PLXNB1O43157 2135 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-201ENST00000261266 A8MUN3 132 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-201ENST00000261266 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-201ENST00000261266 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-201ENST00000261266 C4orf26Q17RF5 130 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-201ENST00000261266 J3QL48 77 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRB-201ENST00000261266 IGF2RP11717 2491 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRB-201ENST00000261266 DSCR10P59022 87 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-201ENST00000261266 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-201ENST00000261266 NOTCH2Q04721 2471 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-201ENST00000261266 PTPN13Q12923 2485 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-201ENST00000261266 SORL1Q92673 2214 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-201ENST00000261266 H7BZZ5 65 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-201ENST00000261266 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-201ENST00000261266 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1W2PNM2 257 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-201ENST00000261266 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa5.78□□□□□ -1.48
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