RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619193.4

RDM1-223, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best)

Gene RDM1, Length 686 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-223	ENST00000619193	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	HERV-K104	P63124	156 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	C16orf95	Q9H693	158 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193		A0A0U1RRA0	63 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	SNCG	O76070	127 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	COX6C	P09669	75 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	CCL18	P55774	89 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	GAGE6	Q13070	117 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193		A0A087WZ39	114 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	SS18	Q15532	418 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	STH	Q8IWL8	128 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	GAGE7	O76087	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	ACYP1	P07311	99 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193		A0A087WYN8	130 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193		A0A1W2PRX2	142 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193		B5MCH6	92 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193		X6R8D5	127 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RDM1-223	ENST00000619193	VWF	P04275	2813 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	MAL	P21145	153 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193		Q8NDZ9	215 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193		Q9HAA7	133 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	CRP	P02741	224 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193		A0A1B0GUV1	79 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	CXCL5	P42830	114 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193		Q6JHZ5	121 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193		H0YGX0	51 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193		Q8IZM0	81 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	TENM2	Q9NT68	2774 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	UBE2L6	O14933	153 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	ATP5G1	P05496	136 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	LINC00158	P58513	81 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	RYR2	Q92736	4967 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	LECT2	O14960	151 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	PAX4	O43316	350 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	NDUFC2	O95298	119 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RDM1-223	ENST00000619193	GYPE	P15421	78 aa		4.03	□□□□□ -1.76

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