RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ERASQ7Z444 233 aa16.87■□□□□ 0.29
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UQCC3Q6UW78 93 aa16.76■□□□□ 0.27
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FA2HQ7L5A8 372 aa16.72■□□□□ 0.27
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TSPAN13O95857 204 aa16.71■□□□□ 0.27
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa16.6■□□□□ 0.25
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGKV2D-28P01615 120 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGLC3P0DOY3 106 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IFITM2Q01629 132 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa16.57■□□□□ 0.24
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 A0A096LNJ9 63 aa16.55■□□□□ 0.24
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RHEBQ15382 184 aa16.53■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa16.53■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa16.53■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 VPREB1P12018 145 aa16.52■□□□□ 0.24
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HBDP02042 147 aa16.51■□□□□ 0.23
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PMCHL1Q16048 86 aa16.5■□□□□ 0.23
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM238C9JI98 176 aa16.48■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 COX17Q14061 63 aa16.48■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM126AQ9H061 195 aa16.48■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM170BQ5T4T1 132 aa16.46■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BAGE3Q86Y29 109 aa16.46■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LINC00304Q8N9R0 145 aa16.46■□□□□ 0.23
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa16.45■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C11orf86A6NJI1 115 aa16.45■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RETNLBQ9BQ08 111 aa16.44■□□□□ 0.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SFTA2Q6UW10 78 aa16.43■□□□□ 0.22
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