RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-205ENST00000577827 CXCL6P80162 114 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZVQ6 151 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 BPTFQ12830 3046 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 A0A0U1RQV1 116 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 HILS1P60008 231 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 PRYO14603 147 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV2D-28P01615 120 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 F8WDY8 70 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF843Q8N446 348 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 FHL3Q13643 280 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 C1orf195Q5TG92 126 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 CEP350Q5VT06 3117 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-205ENST00000577827 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 C16orf95Q9H693 158 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 C1orf137Q5JT78 98 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 C2orf48Q96LS8 159 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV4-1P06312 121 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 PRO0628Q9UI54 55 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 Q9UF83 564 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 CELA1Q9UNI1 258 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 MUC4Q99102 2169 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1B0GW54 56 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 A8MTW9 85 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 C6orf223Q8N319 242 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 LINC01600Q96MT4 127 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 ESRGQ1W209 222 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZQT0 140 aa7.21□□□□□ -1.25
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PTPRM-205ENST00000577827 A6NED7 52 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 A0A096LNI7 61 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 UTRNP46939 3433 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00208Q96KT6 92 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 INAFM1C9JVW0 142 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 LY6G6DO95868 133 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP10-9P60411 292 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 Q8N9L7 120 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 PRR15LQ9BU68 103 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 REG3GQ6UW15 175 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 A0A0J9YWU9 116 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZRU5 148 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 PLA2G2AP14555 144 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF575Q86XF7 245 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRM-205ENST00000577827 C4orf26Q17RF5 130 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-205ENST00000577827 HCG22E2RYF7 251 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 C10orf25Q5T742 122 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 IL17DQ8TAD2 202 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 CASC2Q6XLA1 102 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 ERC2-IT1O76042 136 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 PMAIP1Q13794 54 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 FSHBP01225 129 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 PCNTO95613 3336 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-205ENST00000577827 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.11□□□□□ -1.27
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