RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 LEPROTO15243 131 aa8.94□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.94□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 TM2D2Q9BX73 214 aa8.94□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 H3BRM9 83 aa8.93□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.93□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.92□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 A0A1B0GV90 55 aa8.92□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 TMEM223A0PJW6 202 aa8.92□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF815PA8K554 130 aa8.92□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.92□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.92□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 Q6ZUT4 128 aa8.92□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.92□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 HERVK_113P63121 156 aa8.91□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.91□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.9□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 J3QQQ9 107 aa8.9□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 UBE2D1P51668 147 aa8.9□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.9□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.9□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.9□□□□□ -0.98
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.89□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 FAM104AQ969W3 186 aa8.89□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 HIST1H4GQ99525 98 aa8.89□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.89□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 OXTP01178 125 aa8.88□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 PTTG1IPP53801 180 aa8.88□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 GAGE6Q13070 117 aa8.88□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.88□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.88□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 CEND1Q8N111 149 aa8.87□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.86□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.86□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.86□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.86□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 A6NJY4 79 aa8.86□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 SMIM13P0DJ93 91 aa8.86□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.86□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 KLK12Q9UKR0 248 aa8.86□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.84□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 A0A1B0GUV1 79 aa8.84□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 TMEM262E9PQX1 116 aa8.84□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 CCL25O15444 150 aa8.84□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 COX11Q9Y6N1 276 aa8.84□□□□□ -0.99
SPNS3-202ENST00000572078 TMEM238C9JI98 176 aa8.83□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 MT1HL1P0DM35 61 aa8.83□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.83□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 UBE2WQ96B02 151 aa8.83□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 RNF213Q63HN8 5207 aa8.83□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.82□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 TAX1BP3O14907 124 aa8.82□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 SPINK8P0C7L1 97 aa8.82□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.82□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 TNXBP22105 4242 aa8.81□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 PANO1I0J062 215 aa8.81□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.81□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 SS18Q15532 418 aa8.81□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 RMI2Q96E14 147 aa8.81□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.81□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 LRP2P98164 4655 aa8.8□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 ENHOQ6UWT2 76 aa8.8□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 Q6ZVH6 145 aa8.8□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 C9orf118A6NHY6 69 aa8.79□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 FXYD2P54710 66 aa8.79□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 RBX1P62877 108 aa8.79□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 COX6A2Q02221 97 aa8.79□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 VAMP3Q15836 100 aa8.79□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 COPS9Q8WXC6 57 aa8.79□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.78□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 TIMM17BO60830 172 aa8.78□□□□□ -1
SPNS3-202ENST00000572078 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.77□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 A0A0J9YXY3 114 aa8.77□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 USP17L23D6RBM5 183 aa8.77□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 NDUFA1O15239 70 aa8.77□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 HERV-K104P63124 156 aa8.77□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.76□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.76□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.76□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 SFTA2Q6UW10 78 aa8.76□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.76□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 A0A1B0GWB2 263 aa8.75□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.75□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.75□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 RAB37Q96AX2 223 aa8.75□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.75□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 FABP2P12104 132 aa8.74□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 IFITM1P13164 125 aa8.74□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 UBE2V1Q13404 147 aa8.74□□□□□ -1.01
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