RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552123.1

NPIPB12-208, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family, member B12, human

TSL 4

Gene NPIPB12, Length 464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB12-208	ENST00000552123	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123		A0A0J9YWU9	116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123		F5H768	121 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123		H3BUT2	72 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	UBE2L6	O14933	153 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	LEPROT	O15243	131 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	HERVK_113	P63121	156 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	TAL2	Q16559	108 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	LELP1	Q5T871	98 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	NMU	P48645	174 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123		A0A0J9YY99	117 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123		J3QQQ9	107 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123		Q6Q795	121 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123		Q6ZTC4	211 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NPIPB12-208	ENST00000552123	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	COX6A2	Q02221	97 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123		A0A087WZ39	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123		A0A1B0GX51	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	FOXI1	Q12951	378 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123		A0A0J9YXY3	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123		H3BMG7	143 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123		J3KT08	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	TIMM17B	O60830	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123		A0A1B0GWB2	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	NDUFA1	O15239	70 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	HTN3	P15516	51 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	XG	P55808	180 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	SS18	Q15532	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	ESRG	Q1W209	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	APOM	O95445	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	LY6G6C	O95867	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	IFITM1	P13164	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	REG3A	Q06141	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	CEND1	Q8N111	149 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	LITAF	Q99732	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	GCSH	P23434	173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	WFDC2	Q14508	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB12-208	ENST00000552123	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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