RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524152.5

MSC-AS1-210, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene MSC-AS1, Length 571 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-210ENST00000524152 AMELXQ99217 191 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 NUPR1O60356 82 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 NPSP0C0P6 89 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 Q8IZM0 81 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 Q8N8P6 123 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 C22orf24Q9Y442 160 aa5.63□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGIPA6NJ69 53 aa5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 K7EMI3 77 aa5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 RAB14P61106 215 aa5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.62□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 F8VRH5 84 aa5.61□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 HERVK_113P63121 156 aa5.61□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 SEC11AP67812 179 aa5.61□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.61□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.61□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5.61□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.61□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.61□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 MT-ND4LP03901 98 aa5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 BCE1O60756 84 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 TSPAN13O95857 204 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 G0S2P27469 103 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 CXCL5P42830 114 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 TIMM17AQ99595 171 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A087X002 238 aa5.58□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 CRYGAP11844 174 aa5.58□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 TOMM6Q96B49 74 aa5.58□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A0U1RQV1 116 aa5.57□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 MUC17Q685J3 4493 aa5.57□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.56□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.56□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 PDZD11Q5EBL8 140 aa5.56□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 CLLU1Q5K131 121 aa5.56□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 ERASQ7Z444 233 aa5.56□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.56□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 LINC00167Q96N53 147 aa5.56□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.55□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.55□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 GAGE10A6NGK3 116 aa5.55□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 COX7B2Q8TF08 81 aa5.55□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.55□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.54□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 ADCYAP1P18509 176 aa5.54□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 UQCC3Q6UW78 93 aa5.54□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.54□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.54□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.54□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 UBE2AP49459 152 aa5.53□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 RAB5BP61020 215 aa5.53□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.53□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 CST9LQ9H4G1 147 aa5.53□□□□□ -1.52
MSC-AS1-210ENST00000524152 LINC01549A6NIU2 74 aa5.52□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 ATP5LO75964 103 aa5.52□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 SPINK8P0C7L1 97 aa5.52□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.52□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.52□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.51□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 LINC01546A6NGU7 62 aa5.51□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGKV2D-28P01615 120 aa5.51□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 IFITM2Q01629 132 aa5.51□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 PMVKQ15126 192 aa5.51□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.51□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.5□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 H3BRM9 83 aa5.5□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 SCO1O75880 301 aa5.5□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.5□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.49□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 TMEM218A2RU14 115 aa5.49□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 PFN2P35080 140 aa5.49□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 PRLHP81277 87 aa5.49□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.49□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.49□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.48□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 H3BS24 57 aa5.48□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 FA2HQ7L5A8 372 aa5.48□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 SEC11CQ9BY50 192 aa5.48□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 TMEM126AQ9H061 195 aa5.48□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.48□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 TMEM238C9JI98 176 aa5.47□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGLC3P0DOY3 106 aa5.47□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 VPREB1P12018 145 aa5.47□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 S100PP25815 95 aa5.47□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 TPRXLQ17RH7 258 aa5.47□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.47□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 CDIP1Q9H305 208 aa5.47□□□□□ -1.53
MSC-AS1-210ENST00000524152 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms