RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.72□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 DAND5Q8N907 189 aa2.72□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa2.72□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 C4orf3Q8WVX3 66 aa2.72□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 CLEC2BQ92478 149 aa2.72□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 TMEM101Q96IK0 257 aa2.72□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa2.72□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 MUC6Q6W4X9 2439 aa2.72□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 SPTA1P02549 2419 aa2.71□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa2.71□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 TRAV25A0A0B4J276 109 aa2.71□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 CCDC179H3BU77 68 aa2.71□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 TTC32Q5I0X7 151 aa2.71□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa2.71□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa2.7□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 INAFM2P0DMQ5 153 aa2.7□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 LINC00694P0DN24 101 aa2.7□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 CXCL5P42830 114 aa2.7□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 RPL28P46779 137 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 COX6A2Q02221 97 aa2.7□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 LINC00643Q86TS7 51 aa2.7□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 LINC01587Q99440 93 aa2.7□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 SS18L2Q9UHA2 77 aa2.7□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 C22orf24Q9Y442 160 aa2.7□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 LAMA5O15230 3695 aa2.7□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 DCHS1Q96JQ0 3298 aa2.7□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 ATMQ13315 3056 aa2.7□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.69□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 CRPP02741 224 aa2.69□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 NPC2P61916 151 aa2.69□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 DEFB114Q30KQ6 69 aa2.69□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa2.69□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 C5orf38Q86SI9 138 aa2.69□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 C1orf158Q8N1D5 194 aa2.69□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 TMEM86BQ8N661 226 aa2.69□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.69□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 DYNLRB2Q8TF09 96 aa2.69□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.69□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 TMEM126AQ9H061 195 aa2.69□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa2.69□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 KALRNO60229 2985 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 DEFB136Q30KP8 78 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 LINC01561Q8N1V8 128 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 TMEM243Q9BU79 118 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 DCHS2Q6V1P9 2916 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 HIVEP2P31629 2446 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 MED13LQ71F56 2210 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 A0A1B0GX51 115 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 PLAC8L1A1L4L8 177 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 UQCRQO14949 82 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 PRM2P04554 102 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 Q6JHZ5 121 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 STHQ8IWL8 128 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 LINC00337Q8N6G1 96 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 COX7B2Q8TF08 81 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP2.67□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 CSMD1Q96PZ7 3565 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 IGF2RP11717 2491 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 CEP295Q9C0D2 2601 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 H0YGX0 51 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 ATOX1O00244 68 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 NDUFA7O95182 113 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 BAALC-AS2P0C853 105 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 CRYGAP11844 174 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 HTN1P15515 57 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZTI0 123 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 ESM1Q9NQ30 184 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SGCE-211ENST00000522045 UBE2L6O14933 153 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 DNAL4O96015 105 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 COX7CP15954 63 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 CCL18P55774 89 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 SMIM11BQ8TCY0 68 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa2.65□□□□□ -1.99
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