RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.78□□□□□ -0.84
ITGA3-211ENST00000508100 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.78□□□□□ -0.84
ITGA3-211ENST00000508100 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.77□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 CBLN2Q8IUK8 224 aa9.77□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 VCX2Q9H322 139 aa9.77□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.76□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.76□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 C22orf24Q9Y442 160 aa9.76□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 NUPR1O60356 82 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 A0A0U1RQV1 116 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 PRSS47A8MTI9 375 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 TSPAN13O95857 204 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 Q8IZM0 81 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.72□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 Q8N8P6 123 aa9.72□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 AMELXQ99217 191 aa9.72□□□□□ -0.85
ITGA3-211ENST00000508100 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 ORMDL2Q53FV1 153 aa9.71□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.71□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 NPSP0C0P6 89 aa9.7□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 SEC11AP67812 179 aa9.7□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.7□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.7□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 F8VRH5 84 aa9.69□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 ATP6V1G1O75348 118 aa9.69□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 HERVK_113P63121 156 aa9.69□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.69□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.69□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 K7EMI3 77 aa9.68□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 BCE1O60756 84 aa9.68□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 CRYGAP11844 174 aa9.68□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 S100A1P23297 94 aa9.68□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 IGIPA6NJ69 53 aa9.67□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 SCO1O75880 301 aa9.67□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 G0S2P27469 103 aa9.67□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.67□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.67□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.67□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 COLCA2A8K830 154 aa9.66□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 CXCL5P42830 114 aa9.66□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 A0A087X002 238 aa9.65□□□□□ -0.86
ITGA3-211ENST00000508100 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.64□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 MUC2Q02817 5179 aa9.63□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 LINC01546A6NGU7 62 aa9.63□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.63□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00167Q96N53 147 aa9.63□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 TIMM17AQ99595 171 aa9.62□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 GAGE10A6NGK3 116 aa9.61□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 TRGC2P03986 189 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 UBE2AP49459 152 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 COX7B2Q8TF08 81 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 TOMM6Q96B49 74 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 FA2HQ7L5A8 372 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 ERASQ7Z444 233 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-211ENST00000508100 RAB5BP61020 215 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 LINC01549A6NIU2 74 aa9.56□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.56□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.56□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.55□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00614P0C842 121 aa9.55□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.55□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.55□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.55□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.54□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 SPINK8P0C7L1 97 aa9.54□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.54□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 A0A096LNJ9 63 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 ATP5LO75964 103 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 CDIP1Q9H305 208 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 CST9LQ9H4G1 147 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-211ENST00000508100 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 IGKV2D-28P01615 120 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 H3BRM9 83 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 HBDP02042 147 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 PFN2P35080 140 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00310P59036 64 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 PMVKQ15126 192 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 BAGE3Q86Y29 109 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 PRLHP81277 87 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms