RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.22□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.22□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 VCX2Q9H322 139 aa7.22□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF861PO60384 105 aa7.21□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.21□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.21□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.21□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.21□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.21□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 PRSS47A8MTI9 375 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 NUPR1O60356 82 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 Q8N8P6 123 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 C22orf24Q9Y442 160 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 NPSP0C0P6 89 aa7.18□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 SEC11AP67812 179 aa7.18□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.18□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.18□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.18□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 AMELXQ99217 191 aa7.18□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 K7EMI3 77 aa7.17□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 G0S2P27469 103 aa7.17□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.17□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 LCE4AQ5TA78 99 aa7.17□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.17□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 Q8IZM0 81 aa7.17□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.17□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 A0A0U1RQV1 116 aa7.16□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 TSPAN13O95857 204 aa7.16□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00310P59036 64 aa7.16□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 HERVK_113P63121 156 aa7.16□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.16□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 IGIPA6NJ69 53 aa7.15□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 F8VRH5 84 aa7.15□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.15□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.15□□□□□ -1.26
CNOT4-211ENST00000498534 MUC2Q02817 5179 aa7.14□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 MT-ND4LP03901 98 aa7.14□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.14□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.14□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.14□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 BCE1O60756 84 aa7.13□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 CRYGAP11844 174 aa7.13□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.13□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 CXCL5P42830 114 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.11□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 TIMM17AQ99595 171 aa7.11□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 TOMM6Q96B49 74 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00167Q96N53 147 aa7.1□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 A0A087X002 238 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 ERASQ7Z444 233 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 COX7B2Q8TF08 81 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.09□□□□□ -1.27
CNOT4-211ENST00000498534 A0A1B0GVG6 124 aa7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 GAGE10A6NGK3 116 aa7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 RAB5BP61020 215 aa7.08□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.07□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 LINC01549A6NIU2 74 aa7.07□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.07□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 UBE2AP49459 152 aa7.07□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.07□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 RAB14P61106 215 aa7.06□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.05□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.05□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.05□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.04□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 ATP5LO75964 103 aa7.04□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 ADCYAP1P18509 176 aa7.04□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.04□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 CST9LQ9H4G1 147 aa7.04□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.03□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 H3BRM9 83 aa7.03□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 SPINK8P0C7L1 97 aa7.03□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.03□□□□□ -1.28
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.02□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 PMVKQ15126 192 aa7.02□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.02□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.02□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.01□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.01□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 IGKV2D-28P01615 120 aa7.01□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 PFN2P35080 140 aa7.01□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 CDIP1Q9H305 208 aa7.01□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 CTAG1AP78358 180 aa7□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 RETNLBQ9BQ08 111 aa7□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 GNB1LQ9BYB4 327 aa7□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 LINC01546A6NGU7 62 aa6.99□□□□□ -1.29
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