RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RPS10P5Q9NQ39 176 aa11.84□□□□□ -0.51
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 FABP9Q0Z7S8 132 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q8IZM0 81 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 M0QXV9 152 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UBE2BP63146 152 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGLV7-43P04211 117 aa11.8□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ODF1Q14990 250 aa11.8□□□□□ -0.52
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa11.8□□□□□ -0.52
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 CST9LQ9H4G1 147 aa11.78□□□□□ -0.52
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 PDZD11Q5EBL8 140 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COX7B2Q8TF08 81 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UBR4Q5T4S7 5183 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa11.72□□□□□ -0.53
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 C22orf24Q9Y442 160 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 H0Y9J4 135 aa11.71□□□□□ -0.53
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 NDUFA6P56556 154 aa11.71□□□□□ -0.53
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 H3BRM9 83 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C18orf32Q8TCD1 76 aa11.69□□□□□ -0.54
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRR26Q8N8Z3 221 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SNAPINO95295 136 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A0A096LNJ9 63 aa11.66□□□□□ -0.54
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 TP73-AS1Q9UF72 201 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF861PO60384 105 aa11.63□□□□□ -0.55
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 LINC00167Q96N53 147 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa11.6□□□□□ -0.55
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 PFN2P35080 140 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NKAPP1Q8N9T2 125 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BCE1O60756 84 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LRP2P98164 4655 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C11orf86A6NJI1 115 aa11.56□□□□□ -0.56
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ERG28Q9UKR5 140 aa11.55□□□□□ -0.56
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 YPEL4Q96NS1 127 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COX17Q14061 63 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SCO1O75880 301 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UBE2AP49459 152 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SFTA2Q6UW10 78 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IFI27L1Q96BM0 104 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGKV2D-28P01615 120 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RPL24P83731 157 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CBLN2Q8IUK8 224 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 VPREB1P12018 145 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM223A0PJW6 202 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HSBP1O75506 76 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LINC00158P58513 81 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM19A2Q8N3H0 131 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CRYGAP11844 174 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A0A0U1RRA0 63 aa11.43□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa11.43□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A0A087X002 238 aa11.42□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRGC2P03986 189 aa11.42□□□□□ -0.58
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