RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461623.1

ABCA9-204, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 9, human

TSL 5

Gene ABCA9, Length 2,172 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA9-204	ENST00000461623		H7C423	109 aa		5	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623		J3QR89	54 aa		5	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	TIMM17B	O60830	172 aa		5	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	IGHV3-33	P01772	117 aa		5	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	AZU1	P20160	251 aa		5	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		5	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623		Q6ZUT4	128 aa		5	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		5	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	CHD6	Q8TD26	2715 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	APOM	O95445	188 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	PDZD2	O15018	2839 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	TCL1B	O95988	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	NDUFA1	O15239	70 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	MIA	Q16674	131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	HERVK_113	P63121	156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	IFITM1	P13164	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623		Q6ZTI0	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ABCA9-204	ENST00000461623	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	NF1	P21359	2839 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	INSL3	P51460	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	COX6A2	Q02221	97 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	SLC25A20	O43772	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623		J3QKU1	62 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	UBE2A	P49459	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623		C9JAW5	83 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	CKS1B	P61024	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-204	ENST00000461623	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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