RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460801.5

PTPRN-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 2,239 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-210ENST00000460801 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
PTPRN-210ENST00000460801 LINC00158P58513 81 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 C9JAW5 83 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 H3BNG1 76 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 J3QR89 54 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 M0QXV9 152 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 LINC01620Q4KN68 170 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 COX7A2LO14548 114 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 SLC25A20O43772 301 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 DNAH3Q8TD57 4116 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 COL6A5A8TX70 2615 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 TEN1Q86WV5 123 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 FOXI1Q12951 378 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 LINC01600Q96MT4 127 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 KIAA0087Q14695 138 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 PRR34Q9NV39 138 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 ANK2Q01484 3957 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 PFN2P35080 140 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 CCL18P55774 89 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 Q6ZTC4 211 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 TENM3Q9P273 2699 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 LST1O00453 97 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 C2orf82Q6UX34 121 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 CLEC2BQ92478 149 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 CARD19Q96LW7 228 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 IGKV2D-28P01615 120 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 ANKRD29Q8N6D5 301 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 NOTCH1P46531 2555 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 MALP21145 153 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 KLK12Q9UKR0 248 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRN-210ENST00000460801 A0A0J9YWU9 116 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 CXCL5P42830 114 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 CKS1BP61024 79 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 ENHOQ6UWT2 76 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 CRPP02741 224 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 CFAP161Q6P656 301 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 COX17Q14061 63 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 H3BT86 120 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 C11orf45Q8TAV5 145 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 SPATA25Q9BR10 227 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PTPRN-210ENST00000460801 ESRGQ1W209 222 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 PCP4P48539 62 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 SPAG11BQ08648 103 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 UBE2WQ96B02 151 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 TRACP01848 142 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 C6orf223Q8N319 242 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 C10orf25Q5T742 122 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 FAM218AQ96MZ4 157 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 NDUFC2O95298 119 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 K7EIL1 84 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 MUC7Q8TAX7 377 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 SIGMAR1Q99720 223 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 CDIP1Q9H305 208 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRN-210ENST00000460801 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 H0YGX0 51 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 MGAM2Q2M2H8 2515 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 Q8NDZ9 215 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 MRAPQ8TCY5 172 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 A0A087WYN8 130 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 TMEM126AQ9H061 195 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 Q9HAA7 133 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRN-210ENST00000460801 C22orf24Q9Y442 160 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms