RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 MRAPQ8TCY5 172 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 M0QXV9 152 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 COX6CP09669 75 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 H7C2G1 150 aa12.75□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 COX7A2LO14548 114 aa12.75□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 CXCL5P42830 114 aa12.75□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 LYPD5Q6UWN5 251 aa12.75□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 ATXN8Q156A1 80 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 DEFB121Q5J5C9 76 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 PRR34Q9NV39 138 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 TRIAP1O43715 76 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 C6orf226Q5I0X4 101 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 CLPSL2Q6UWE3 100 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A0U1RRA0 63 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 CBY1Q9Y3M2 126 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC01600Q96MT4 127 aa12.72□□□□□ -0.37
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SH3BP2-202ENST00000435136 Q8N3U1 123 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A0J9YWU9 116 aa12.68□□□□□ -0.38
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SH3BP2-202ENST00000435136 CFAP161Q6P656 301 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 SPATA25Q9BR10 227 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
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SH3BP2-202ENST00000435136 C11orf45Q8TAV5 145 aa12.67□□□□□ -0.38
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SH3BP2-202ENST00000435136 RNF151Q2KHN1 245 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC01620Q4KN68 170 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 MTURNQ8N3F0 131 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 MUC7Q8TAX7 377 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 COL7A1Q02388 2944 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 TEN1Q86WV5 123 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC25A20O43772 301 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 LST1O00453 97 aa12.65□□□□□ -0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 CCL18P55774 89 aa12.65□□□□□ -0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 VPS25Q9BRG1 176 aa12.65□□□□□ -0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 TM2D3Q9BRN9 247 aa12.65□□□□□ -0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 KLK12Q9UKR0 248 aa12.65□□□□□ -0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa12.64□□□□□ -0.39
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SH3BP2-202ENST00000435136 PPDPFLQ8WWR9 84 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 RPL28P46779 137 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 ANKRD29Q8N6D5 301 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 H3BT86 120 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 IGKV2D-28P01615 120 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 C2orf82Q6UX34 121 aa12.6□□□□□ -0.39
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SH3BP2-202ENST00000435136 TRAV10A0A0B4J240 114 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 SPAG11BQ08648 103 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC00337Q8N6G1 96 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 B9D2Q9BPU9 175 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 NDUFC2O95298 119 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP2-202ENST00000435136 ESRGQ1W209 222 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP2-202ENST00000435136 C15orf53Q8NAA6 179 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC01556Q5JQF7 62 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP2-202ENST00000435136 CLEC2BQ92478 149 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP2-202ENST00000435136 UBE2WQ96B02 151 aa12.57□□□□□ -0.4
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SH3BP2-202ENST00000435136 CARD19Q96LW7 228 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP2-202ENST00000435136 TRACP01848 142 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP2-202ENST00000435136 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa12.53□□□□□ -0.4
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SH3BP2-202ENST00000435136 H0YGX0 51 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP2-202ENST00000435136 DNAH10OSP0CZ25 163 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP2-202ENST00000435136 F8WDY8 70 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP2-202ENST00000435136 SMIM11BQ8TCY0 68 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP2-202ENST00000435136 TENM3Q9P273 2699 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP2-202ENST00000435136 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP2-202ENST00000435136 C6orf223Q8N319 242 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP2-202ENST00000435136 C1orf43Q9BWL3 253 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP2-202ENST00000435136 C10orf25Q5T742 122 aa12.46□□□□□ -0.41
SH3BP2-202ENST00000435136 C2orf48Q96LS8 159 aa12.46□□□□□ -0.41
SH3BP2-202ENST00000435136 STAB2Q8WWQ8 2551 aa12.46□□□□□ -0.41
SH3BP2-202ENST00000435136 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
SH3BP2-202ENST00000435136 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
SH3BP2-202ENST00000435136 OR13C6PQ8NH95 151 aa12.45□□□□□ -0.42
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM126AQ9H061 195 aa12.45□□□□□ -0.42
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