RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00269Q8N2A0 174 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 PKIGQ9Y2B9 76 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPAN13O95857 204 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 ANGP03950 147 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 SS18Q15532 418 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB121Q5J5C9 76 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZTC4 211 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 PRO1854Q9UHT4 67 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0J9YWU9 116 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 MIAQ16674 131 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 MRAPQ8TCY5 172 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 COX7B2Q8TF08 81 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 SPANXDQ9BXN6 97 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 SPANXCQ9NY87 97 aa2.74□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 MGAM2Q2M2H8 2515 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 H3BMG7 143 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 SCGB1C2P0DMR2 95 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 TENM3Q9P273 2699 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A087WZ39 114 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 TIMM17BO60830 172 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 Q1RN00 199 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 LELP1Q5T871 98 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 SH2D6Q7Z4S9 175 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 ERG28Q9UKR5 140 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV3-33P01772 117 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMB2P49721 201 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 REG3AQ06141 175 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 C6orf226Q5I0X4 101 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 LYPD5Q6UWN5 251 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 MTURNQ8N3F0 131 aa2.73□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0B4J2C4 111 aa2.72□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 IFITM1P13164 125 aa2.72□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 C11orf45Q8TAV5 145 aa2.72□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00308Q8TCZ7 52 aa2.72□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 KLK12Q9UKR0 248 aa2.72□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAH3Q8TD57 4116 aa2.72□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa2.72□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 F8WDY8 70 aa2.72□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 K7EIL1 84 aa2.72□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00158P58513 81 aa2.72□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 CD164L2Q6UWJ8 174 aa2.72□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.72□□□□□ -1.97
LRRTM4-201ENST00000409088 COX7A2LO14548 114 aa2.71□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 MALP21145 153 aa2.71□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 PFN2P35080 140 aa2.71□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 WFDC2Q14508 124 aa2.71□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 LYRM7Q5U5X0 104 aa2.71□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.71□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 TCL1BO95988 128 aa2.71□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 CKS1BP61024 79 aa2.71□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 C5orf47Q569G3 176 aa2.71□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 C2orf82Q6UX34 121 aa2.71□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2WQ96B02 151 aa2.71□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA25Q9BR10 227 aa2.71□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 V9GYY9 64 aa2.71□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 GAGE12HA6NDE8 117 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 H3BNG1 76 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 ESRGQ1W209 222 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 OCIAD2Q56VL3 154 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 WFDC10BQ8IUB3 73 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 COPS9Q8WXC6 57 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 F8W1H4 67 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 CRPP02741 224 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIAP1O43715 76 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXI1Q12951 378 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 ETDBQ3ZM63 59 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 ENHOQ6UWT2 76 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 Q8IZM0 81 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 SIGMAR1Q99720 223 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC01561Q8N1V8 128 aa2.69□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.69□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 TM2D3Q9BRN9 247 aa2.69□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa2.69□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 PRR34Q9NV39 138 aa2.69□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa2.69□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 K7ERU9 68 aa2.69□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 COX6CP09669 75 aa2.69□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 CCL18P55774 89 aa2.69□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA0087Q14695 138 aa2.69□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 LCE4AQ5TA78 99 aa2.69□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa2.69□□□□□ -1.98
LRRTM4-201ENST00000409088 PRO0461Q9UI25 63 aa2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101 ms