RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384557.1

RNU6-1274P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1274, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1274P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SBF2Q86WG5 1849 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TULP4Q9NRJ4 1543 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ABCA2Q9BZC7 2435 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ARHGEF5Q12774 1597 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PEG3Q9GZU2 1588 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LOC730098B7Z3J9 87 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PKIAP61925 76 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ETDBQ3ZM63 59 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DEFB105AQ8NG35 78 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FYCO1Q9BQS8 1478 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PSME4Q14997 1843 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 D6R8Y8 96 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 I3L3M4 83 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LEPROTL1O95214 131 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GYPAP02724 150 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MUSTN1Q8IVN3 82 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TOP2BQ02880 1626 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 VPS8Q8N3P4 1428 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 COL7A1Q02388 2944 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NLRP1Q9C000 1473 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CACNA1AO00555 2505 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ABCC2Q92887 1545 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SMIM11AP58511 58 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MYO7BQ6PIF6 2116 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PLXNB2O15031 1838 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SNHG12Q9BXW3 62 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 Q9H521 79 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PSENENQ9NZ42 101 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 APLNQ9ULZ1 77 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TENM4Q6N022 2769 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 USF3Q68DE3 2245 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CSMD3Q7Z407 3707 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PLCE1Q9P212 2302 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1274P-201ENST00000384557 WNK2Q9Y3S1 2297 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 F8WEM9 126 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KLK9Q2XQG4 91 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PRM1P04553 51 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 IGLC2P0DOY2 106 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 IGLC3P0DOY3 106 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SPRR2DP22532 72 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PEA15Q15121 130 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ABCC10Q5T3U5 1492 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NRXN1Q9ULB1 1477 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 A0A0G2JMZ2 1700 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ZFHX3Q15911 3703 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FLNCQ14315 2725 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CHD6Q8TD26 2715 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CCL22O00626 93 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 COL4A6Q14031 1691 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 HIGD1BQ9P298 99 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP-0□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NCOR1O75376 2440 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 BTAF1O14981 1849 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DEFB112Q30KQ8 113 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PYY3Q5JQD4 70 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 V9GYS6 101 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CLIP1P30622 1438 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CYB5AP00167 134 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PLGLAQ15195 96 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 HEPN1Q6WQI6 88 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 C20orf78Q9BR46 151 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LPAP08519 4548 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SCN7AQ01118 1682 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KIAA0556O60303 1618 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ATP10BO94823 1461 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 A0A1B0GUT8 65 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 M0R2T5 61 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1274P-201ENST00000384557 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TCHHQ07283 1943 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NMSQ5H8A3 153 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SAMD9Q5K651 1589 aa-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77 ms