RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383974.1

RNU6-1040P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1040, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1040P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1040P-201ENST00000383974 UQCR11O14957 56 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NDUFA3O95167 84 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DEFB136Q30KP8 78 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TMEM244Q5VVB8 128 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ERCC6Q03468 1493 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PRDM2Q13029 1718 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 A6NIN4 97 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DPM2O94777 84 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IFNA17P01571 189 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MNS1Q8NEH6 495 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FDCSPQ8NFU4 85 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LCN9Q8WX39 176 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PSME4Q14997 1843 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 B2MP61769 119 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 UBE2G1P62253 170 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 A0A0G2JMZ2 1700 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MYH6P13533 1939 aa-2.66□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa-2.66□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP-2.66□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SCN11AQ9UI33 1791 aa-2.66□□□□□ -2.83
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 A8MTW9 85 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 APOC3P02656 99 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TPPP2P59282 170 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TRIQKQ629K1 86 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GID8Q9NWU2 228 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ATPIF1Q9UII2 106 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 V9GYH0 126 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PXDNQ92626 1479 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NMSQ5H8A3 153 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C5orf38Q86SI9 138 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CUX1P39880 1505 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SEC11AP67812 179 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TMEM35BQ8NCS4 154 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 COPZ2Q9P299 210 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C4AP0C0L4 1744 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C4BP0C0L5 1744 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 VCANP13611 3396 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ATP7BP35670 1465 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NLRP1Q9C000 1473 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IGLC7A0M8Q6 106 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 K7EP13 123 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SIX6O95475 246 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CHMP6Q96FZ7 201 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SMARCA2P51531 1590 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SHROOM2Q13796 1616 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 A0A1B0GU69 56 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LENEPQ9Y5L5 61 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 USP34Q70CQ2 3546 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MYH8P13535 1937 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MIC13Q5XKP0 118 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PLXNC1O60486 1568 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 BTAF1O14981 1849 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LCE6AA0A183 80 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SFT2D2O95562 160 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DEFB130BP0DP73 79 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DEFB130AP0DP74 79 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ROCK1Q13464 1354 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1040P-201ENST00000383974 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MYH13Q9UKX3 1938 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1040P-201ENST00000383974 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SNCAP37840 140 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TMEM128Q5BJH2 165 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SAMD13Q5VXD3 122 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PCBD2Q9H0N5 130 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DOCK2Q92608 1830 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ARHGEF10O15013 1369 aa-2.74□□□□□ -2.85
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IGLC1P0CG04 106 aa-2.74□□□□□ -2.85
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SPART-AS1P0CW21 52 aa-2.74□□□□□ -2.85
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LINC00158P58513 81 aa-2.74□□□□□ -2.85
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CCL8P80075 99 aa-2.74□□□□□ -2.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.5 ms