RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325103.10

HPS1-201, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-201ENST00000325103 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9□□□□□ -0.97
HPS1-201ENST00000325103 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-201ENST00000325103 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-201ENST00000325103 HERV-K104P63124 156 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-201ENST00000325103 CLEC2BQ92478 149 aa8.99□□□□□ -0.97
HPS1-201ENST00000325103 LELP1Q5T871 98 aa8.98□□□□□ -0.97
HPS1-201ENST00000325103 SPAG11BQ08648 103 aa8.98□□□□□ -0.97
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HPS1-201ENST00000325103 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.95□□□□□ -0.98
HPS1-201ENST00000325103 ATXN8Q156A1 80 aa8.95□□□□□ -0.98
HPS1-201ENST00000325103 TENM3Q9P273 2699 aa8.95□□□□□ -0.98
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HPS1-201ENST00000325103 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.94□□□□□ -0.98
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HPS1-201ENST00000325103 MDFIQ99750 246 aa8.94□□□□□ -0.98
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HPS1-201ENST00000325103 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.92□□□□□ -0.98
HPS1-201ENST00000325103 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
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HPS1-201ENST00000325103 K7EIL1 84 aa8.9□□□□□ -0.98
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HPS1-201ENST00000325103 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.85□□□□□ -0.99
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HPS1-201ENST00000325103 C10orf25Q5T742 122 aa8.84□□□□□ -0.99
HPS1-201ENST00000325103 SNCGO76070 127 aa8.84□□□□□ -0.99
HPS1-201ENST00000325103 ENHOQ6UWT2 76 aa8.84□□□□□ -0.99
HPS1-201ENST00000325103 DPH3Q96FX2 82 aa8.84□□□□□ -0.99
HPS1-201ENST00000325103 CXCL5P42830 114 aa8.82□□□□□ -1
HPS1-201ENST00000325103 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.82□□□□□ -1
HPS1-201ENST00000325103 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.81□□□□□ -1
HPS1-201ENST00000325103 PCP4P48539 62 aa8.81□□□□□ -1
HPS1-201ENST00000325103 FOXI1Q12951 378 aa8.81□□□□□ -1
HPS1-201ENST00000325103 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.81□□□□□ -1
HPS1-201ENST00000325103 SLPIP03973 132 aa8.81□□□□□ -1
HPS1-201ENST00000325103 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.8□□□□□ -1
HPS1-201ENST00000325103 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.8□□□□□ -1
HPS1-201ENST00000325103 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.8□□□□□ -1
HPS1-201ENST00000325103 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.8□□□□□ -1
HPS1-201ENST00000325103 TEN1Q86WV5 123 aa8.8□□□□□ -1
HPS1-201ENST00000325103 GAGE2BQ13066 116 aa8.78□□□□□ -1
HPS1-201ENST00000325103 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.78□□□□□ -1
HPS1-201ENST00000325103 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.78□□□□□ -1
HPS1-201ENST00000325103 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.77□□□□□ -1.01
HPS1-201ENST00000325103 M0R2N4 97 aa8.77□□□□□ -1.01
HPS1-201ENST00000325103 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
HPS1-201ENST00000325103 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
HPS1-201ENST00000325103 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.77□□□□□ -1.01
HPS1-201ENST00000325103 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.76□□□□□ -1.01
HPS1-201ENST00000325103 C6orf99Q4VX62 202 aa8.75□□□□□ -1.01
HPS1-201ENST00000325103 TMEM126AQ9H061 195 aa8.75□□□□□ -1.01
HPS1-201ENST00000325103 Q6ZRU5 148 aa8.75□□□□□ -1.01
HPS1-201ENST00000325103 LST1O00453 97 aa8.75□□□□□ -1.01
HPS1-201ENST00000325103 SYCNQ0VAF6 134 aa8.75□□□□□ -1.01
HPS1-201ENST00000325103 RMI2Q96E14 147 aa8.75□□□□□ -1.01
HPS1-201ENST00000325103 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.74□□□□□ -1.01
HPS1-201ENST00000325103 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.74□□□□□ -1.01
HPS1-201ENST00000325103 IGKV2D-28P01615 120 aa8.74□□□□□ -1.01
HPS1-201ENST00000325103 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HPS1-201ENST00000325103 KIAA0087Q14695 138 aa8.74□□□□□ -1.01
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