RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635310.1

NRXN1-241, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene NRXN1, Length 1,246 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-241ENST00000635310 SPATA25Q9BR10 227 aa7.8□□□□□ -1.16
NRXN1-241ENST00000635310 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.79□□□□□ -1.16
NRXN1-241ENST00000635310 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.79□□□□□ -1.16
NRXN1-241ENST00000635310 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.78□□□□□ -1.16
NRXN1-241ENST00000635310 A0A096LPF7 62 aa7.78□□□□□ -1.16
NRXN1-241ENST00000635310 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.78□□□□□ -1.16
NRXN1-241ENST00000635310 GCSHP23434 173 aa7.78□□□□□ -1.16
NRXN1-241ENST00000635310 C12orf74Q32Q52 190 aa7.78□□□□□ -1.16
NRXN1-241ENST00000635310 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
NRXN1-241ENST00000635310 HIST1H4GQ99525 98 aa7.78□□□□□ -1.16
NRXN1-241ENST00000635310 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.78□□□□□ -1.16
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NRXN1-241ENST00000635310 H3BNG1 76 aa7.77□□□□□ -1.17
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NRXN1-241ENST00000635310 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.77□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.77□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 CEND1Q8N111 149 aa7.77□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.77□□□□□ -1.17
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NRXN1-241ENST00000635310 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 A0A0J9YWU9 116 aa7.75□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 TMEM238C9JI98 176 aa7.75□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 TMEM262E9PQX1 116 aa7.75□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 FXYD2P54710 66 aa7.75□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 LELP1Q5T871 98 aa7.75□□□□□ -1.17
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NRXN1-241ENST00000635310 TM2D2Q9BX73 214 aa7.75□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.74□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 RBX1P62877 108 aa7.74□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 COX6A2Q02221 97 aa7.74□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.17
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NRXN1-241ENST00000635310 Q6ZTC4 211 aa7.74□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.74□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.74□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 COX11Q9Y6N1 276 aa7.74□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.73□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.73□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 TAX1BP3O14907 124 aa7.73□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 CCL25O15444 150 aa7.73□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 SS18Q15532 418 aa7.73□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.73□□□□□ -1.17
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NRXN1-241ENST00000635310 SMIM13P0DJ93 91 aa7.72□□□□□ -1.17
NRXN1-241ENST00000635310 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.72□□□□□ -1.17
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NRXN1-241ENST00000635310 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.69□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.69□□□□□ -1.18
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NRXN1-241ENST00000635310 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.68□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 C9orf118A6NHY6 69 aa7.68□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 K7EP13 123 aa7.68□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 HERV-K104P63124 156 aa7.68□□□□□ -1.18
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NRXN1-241ENST00000635310 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 SFTA2Q6UW10 78 aa7.68□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.68□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 COX7B2Q8TF08 81 aa7.68□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 RAB37Q96AX2 223 aa7.68□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 Q9H8V8 135 aa7.68□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 A0A1B0GWB2 263 aa7.67□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 REG3AQ06141 175 aa7.67□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 VAMP3Q15836 100 aa7.67□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.67□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.67□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.66□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 K7ERJ3 54 aa7.66□□□□□ -1.18
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NRXN1-241ENST00000635310 XCL1P47992 114 aa7.66□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 MIAQ16674 131 aa7.66□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.66□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 COPS9Q8WXC6 57 aa7.66□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.66□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 H3BUT2 72 aa7.65□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 IFITM1P13164 125 aa7.65□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.65□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 C5orf38Q86SI9 138 aa7.65□□□□□ -1.18
NRXN1-241ENST00000635310 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
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