RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		9.3	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	SPANXC	Q9NY87	97 aa		9.3	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		9.3	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A20	O43772	301 aa		9.3	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	HILS1	P60008	231 aa		9.3	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	TEN1	Q86WV5	123 aa		9.3	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		9.29	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	CARD19	Q96LW7	228 aa		9.29	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		9.29	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		9.29	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	9.28	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		9.28	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		9.28	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFA1	O15239	70 aa		9.28	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	DEFB130B	P0DP73	79 aa		9.28	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	DEFB130A	P0DP74	79 aa		9.28	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		9.28	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM243	Q9BU79	118 aa		9.28	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		9.27	□□□□□ -0.92
BRF1-222	ENST00000635152	PF4	P02776	101 aa		9.27	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	KRTAP10-3	P60369	221 aa		9.27	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		9.27	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		9.26	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		9.26	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		9.26	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		9.26	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	ATXN8	Q156A1	80 aa		9.26	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		9.26	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	CLEC2B	Q92478	149 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	LINC01620	Q4KN68	170 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		9.24	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	FHL2	Q14192	279 aa		9.24	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		9.24	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		9.24	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152		F5H768	121 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	CRLF1	O75462	422 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC179	H3BU77	68 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	TIMM17B	O60830	172 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	COX6C	P09669	75 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	IFITM1	P13164	125 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		9.21	□□□□□ -0.93
BRF1-222	ENST00000635152	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		9.21	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		9.21	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	ATR	Q13535	2644 aa		9.2	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152		A0A096LPF7	62 aa		9.2	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		9.2	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	LY6G6D	O95868	133 aa		9.2	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		9.2	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		9.18	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	DEFB4A	O15263	64 aa		9.18	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	C2orf82	Q6UX34	121 aa		9.18	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	9.18	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152		H7C423	109 aa		9.18	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM262	E9PQX1	116 aa		9.18	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	GYPE	P15421	78 aa		9.18	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	C5orf38	Q86SI9	138 aa		9.18	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	CITED1	Q99966	193 aa		9.18	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	INAFM1	C9JVW0	142 aa		9.17	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	9.17	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		9.16	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	COX7B2	Q8TF08	81 aa		9.16	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	LST1	O00453	97 aa		9.16	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	9.16	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152		X6R8D5	127 aa		9.15	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		9.15	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	C3orf56	Q8N813	242 aa		9.15	□□□□□ -0.94
BRF1-222	ENST00000635152	GAGE2B	Q13066	116 aa		9.14	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	DEFB135	Q30KP9	77 aa		9.14	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	GAGE2E	Q4V326	116 aa		9.14	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		9.14	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		9.14	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2W	Q96B02	151 aa		9.14	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152		M0QXV9	152 aa		9.14	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	XCL1	P47992	114 aa		9.14	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	LINC00158	P58513	81 aa		9.14	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		9.14	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		9.14	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	COPS9	Q8WXC6	57 aa		9.13	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	HIVEP1	P15822	2718 aa		9.13	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	PFN2	P35080	140 aa		9.13	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	TTC32	Q5I0X7	151 aa		9.12	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		9.12	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	SNCG	O76070	127 aa		9.12	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	PRO0255	Q9UI72	69 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	9.11	□□□□□ -0.95
BRF1-222	ENST00000635152	COX7A2L	O14548	114 aa		9.1	□□□□□ -0.95

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