RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SMR3AQ99954 134 aa8.82□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.82□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.82□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.82□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM243Q9BU79 118 aa8.81□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C16orf95Q9H693 158 aa8.81□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.81□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.81□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.81□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.81□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC01620Q4KN68 170 aa8.81□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.81□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRIMA1Q86XR5 153 aa8.81□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.81□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CDIP1Q9H305 208 aa8.81□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CLEC2BQ92478 149 aa8.8□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.8□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.8□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COX6CP09669 75 aa8.8□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DEFB130BP0DP73 79 aa8.79□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DEFB130AP0DP74 79 aa8.79□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.79□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TIMM17BO60830 172 aa8.79□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IFITM1P13164 125 aa8.79□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.78□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.78□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PF4P02776 101 aa8.78□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HILS1P60008 231 aa8.78□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MT-ATP8P03928 68 aa8.77□□□□□ -1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.77□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.77□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 J3QKU1 62 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 XGP55808 180 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 F5H768 121 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C2orf82Q6UX34 121 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FHL2Q14192 279 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 H7C423 109 aa8.74□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CRLF1O75462 422 aa8.74□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KRTAP10-3P60369 221 aa8.74□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.74□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 M0QXV9 152 aa8.74□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.73□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VWFP04275 2813 aa8.73□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A096LPF7 62 aa8.72□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LST1O00453 97 aa8.72□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UBE2WQ96B02 151 aa8.72□□□□□ -1.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM262E9PQX1 116 aa8.71□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C5orf47Q569G3 176 aa8.71□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C5orf38Q86SI9 138 aa8.71□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COX7B2Q8TF08 81 aa8.71□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COPS9Q8WXC6 57 aa8.71□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GYPEP15421 78 aa8.71□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.7□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.7□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.69□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DEFB4AO15263 64 aa8.69□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00158P58513 81 aa8.69□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.69□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.69□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 H3BT86 120 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LY6G6DO95868 133 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PFN2P35080 140 aa8.67□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.67□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC179H3BU77 68 aa8.67□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 XCL1P47992 114 aa8.67□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COX7A2LO14548 114 aa8.67□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.66□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 X6R8D5 127 aa8.66□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.65□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.65□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DEFB135Q30KP9 77 aa8.65□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.65□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.65□□□□□ -1.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 INAFM1C9JVW0 142 aa8.65□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CRPP02741 224 aa8.65□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATRQ13535 2644 aa8.65□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.64□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SNCGO76070 127 aa8.64□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A087WZ39 114 aa8.64□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.64□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC01600Q96MT4 127 aa8.64□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WIPF1O43516 503 aa8.63□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.63□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRO0255Q9UI72 69 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 202.2 ms