RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567329.1

USP7-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 7, human

TSL 4

Gene USP7, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP7-217	ENST00000567329	MUC4	Q99102	2169 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		5.04	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	CD28	P10747	220 aa		5.04	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	DPH3	Q96FX2	82 aa		5.04	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	UPK3B	Q9BT76	320 aa		5.04	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		5.04	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		5.04	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	C22orf24	Q9Y442	160 aa		5.04	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329		A0A1W2PPR1	153 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329		A8MTW9	85 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329		H0YGX0	51 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	DUX5	Q96PT3	197 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP7-217	ENST00000567329	TMEM89	A2RUT3	159 aa		5.02	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	IGHG2	P01859	326 aa		5.02	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.02	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		5.02	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	LINC01560	Q8TB33	94 aa		5.02	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		5.01	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		5.01	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		5.01	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		5.01	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	NDUFC2	O95298	119 aa		5.01	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	ATP5J2	P56134	94 aa		5.01	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		5.01	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	MRAP	Q8TCY5	172 aa		5.01	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	VPS13C	Q709C8	3753 aa		5.01	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	EPM2A	B3EWF7	344 aa		5	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329		F6UB75	175 aa		5	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329		K7EQG2	157 aa		5	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	SAA4	P35542	130 aa		5	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	PROK1	P58294	105 aa		5	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		5	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		5	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		5	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	ABCA4	P78363	2273 aa		5	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		5	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329		A0A0A0MQY5	61 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329		Q6ZSV7	163 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	PSMB8	P28062	276 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	DEFB1	P60022	68 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	LMO4	P61968	165 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329		A6NDX4	124 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	RS1	O15537	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329		Q9H8V8	135 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	CUBN	O60494	3623 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP7-217	ENST00000567329	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	DNAL4	O96015	105 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329		Q8N2B8	174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329		F5H768	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	CCK	P06307	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329		Q5XG85	94 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329		A8MZ25	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	CRP	P02741	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	EDN2	P20800	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	NPC2	P61916	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	COX6A2	Q02221	97 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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