RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	GAGE12F	P0CL80	117 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RRN3-205	ENST00000563559	GAGE12G	P0CL81	117 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RRN3-205	ENST00000563559	GAGE12I	P0CL82	117 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RRN3-205	ENST00000563559	CKS1B	P61024	79 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RRN3-205	ENST00000563559	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.06	□□□□□ -0.32
RRN3-205	ENST00000563559	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
RRN3-205	ENST00000563559	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RRN3-205	ENST00000563559	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RRN3-205	ENST00000563559	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RRN3-205	ENST00000563559	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC2B	Q92478	149 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RRN3-205	ENST00000563559	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RRN3-205	ENST00000563559	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RRN3-205	ENST00000563559	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0U1RRA0	63 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	COX7A2L	O14548	114 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	MTOR	P42345	2549 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		13	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		13	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		13	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		13	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	SNCG	O76070	127 aa		12.99	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	FHL2	Q14192	279 aa		12.99	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	ACAN	P16112	2415 aa		12.99	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	PF4	P02776	101 aa		12.98	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	HILS1	P60008	231 aa		12.98	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		12.98	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	COX7B2	Q8TF08	81 aa		12.98	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	CITED1	Q99966	193 aa		12.98	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	TENM4	Q6N022	2769 aa		12.98	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		12.97	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	GAGE6	Q13070	117 aa		12.97	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	PDZD2	O15018	2839 aa		12.96	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		12.96	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		12.96	□□□□□ -0.33
RRN3-205	ENST00000563559	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	TRAC	P01848	142 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	GAGE2B	Q13066	116 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	GAGE2E	Q4V326	116 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087WZ39	114 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559		Q6Q795	121 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	ITPR2	Q14571	2701 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	CRP	P02741	224 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2G2A	P14555	144 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	CUBN	O60494	3623 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		12.9	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		12.9	□□□□□ -0.34
RRN3-205	ENST00000563559	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB130B	P0DP73	79 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB130A	P0DP74	79 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	ACYP1	P07311	99 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00158	P58513	81 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	CRLF1	O75462	422 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GUV1	79 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	GYPE	P15421	78 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	TTC32	Q5I0X7	151 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	HIVEP2	P31629	2446 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	C5orf38	Q86SI9	138 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	PRO0255	Q9UI72	69 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		12.83	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV2D-28	P01615	120 aa		12.83	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	SS18	Q15532	418 aa		12.83	□□□□□ -0.35
RRN3-205	ENST00000563559	CCL18	P55774	89 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRN3-205	ENST00000563559		J3QKU1	62 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRN3-205	ENST00000563559	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRN3-205	ENST00000563559		X6R8D5	127 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRN3-205	ENST00000563559		H0YGX0	51 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP10-3	P60369	221 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRN3-205	ENST00000563559	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRN3-205	ENST00000563559	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RRN3-205	ENST00000563559	LYRM9	A8MSI8	78 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRN3-205	ENST00000563559	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RRN3-205	ENST00000563559		Q8IZM0	81 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RRN3-205	ENST00000563559	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36

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