RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561204.5

MEIS3-211, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEIS3, Length 2,195 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM243Q9BU79 118 aa12.32□□□□□ -0.44
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MEIS3-211ENST00000561204 A0A0U1RRA0 63 aa12.3□□□□□ -0.44
MEIS3-211ENST00000561204 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa12.3□□□□□ -0.44
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MEIS3-211ENST00000561204 H3BT86 120 aa12.22□□□□□ -0.45
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MEIS3-211ENST00000561204 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa12.09□□□□□ -0.47
MEIS3-211ENST00000561204 VWFP04275 2813 aa12.09□□□□□ -0.47
MEIS3-211ENST00000561204 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa12.09□□□□□ -0.47
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MEIS3-211ENST00000561204 LINC00158P58513 81 aa12.09□□□□□ -0.47
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MEIS3-211ENST00000561204 PFN2P35080 140 aa12.05□□□□□ -0.48
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MEIS3-211ENST00000561204 GAGE2DQ9UEU5 116 aa12.05□□□□□ -0.48
MEIS3-211ENST00000561204 C22orf24Q9Y442 160 aa12.04□□□□□ -0.48
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MEIS3-211ENST00000561204 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
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