RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-211ENST00000552253 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-211ENST00000552253 COPS9Q8WXC6 57 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-211ENST00000552253 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-211ENST00000552253 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-211ENST00000552253 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-211ENST00000552253 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.18□□□□□ -1.74
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PTPRB-211ENST00000552253 GAGE7O76087 117 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-211ENST00000552253 GAGE12FP0CL80 117 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-211ENST00000552253 GAGE12GP0CL81 117 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-211ENST00000552253 GAGE12IP0CL82 117 aa4.18□□□□□ -1.74
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PTPRB-211ENST00000552253 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
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PTPRB-211ENST00000552253 H3BT86 120 aa4.17□□□□□ -1.74
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PTPRB-211ENST00000552253 C22orf24Q9Y442 160 aa4.17□□□□□ -1.74
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PTPRB-211ENST00000552253 C16orf95Q9H693 158 aa4.17□□□□□ -1.74
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PTPRB-211ENST00000552253 TLN2Q9Y4G6 2542 aa4.16□□□□□ -1.74
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PTPRB-211ENST00000552253 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 X6R8D5 127 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 TENM4Q6N022 2769 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 ACANP16112 2415 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 HILS1P60008 231 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 LCE2CQ5TA81 110 aa4.1□□□□□ -1.75
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