RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491228.1

LRP2-204, Transcript of LDL receptor related protein 2, human

TSL 4

Gene LRP2, Length 556 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRP2-204	ENST00000491228	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	VPREB1	P12018	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	GAGE6	Q13070	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228		Q8IZM0	81 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	COX6A2	Q02221	97 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	NDUFC2	O95298	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	FHL2	Q14192	279 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	PRM2	P04554	102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	MIF	P14174	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LRP2-204	ENST00000491228	SPTBN2	O15020	2390 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228		A0A0U1RRA0	63 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	CRLF1	O75462	422 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	DAD1	P61803	113 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	ATM	Q13315	3056 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	CR1	P17927	2039 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228		Q9UF83	564 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	ATOX1	O00244	68 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	PDE6G	P18545	87 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	PFN2	P35080	140 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	MED13L	Q71F56	2210 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	KALRN	O60229	2985 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	IGF2R	P11717	2491 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228		F8WDY8	70 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	LY6G6D	O95868	133 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	XCL1	P47992	114 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	CCL18	P55774	89 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		4.48	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		4.48	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.48	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.48	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	REG3A	Q06141	175 aa		4.48	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	LELP1	Q5T871	98 aa		4.48	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.48	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	BSN	Q9UPA5	3926 aa		4.48	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.48	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	LRBA	P50851	2863 aa		4.47	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228		H3BNG1	76 aa		4.47	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	LECT2	O14960	151 aa		4.47	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.47	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.47	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.47	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
LRP2-204	ENST00000491228	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.46	□□□□□ -1.7
LRP2-204	ENST00000491228	UQCRQ	O14949	82 aa		4.46	□□□□□ -1.7
LRP2-204	ENST00000491228	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.46	□□□□□ -1.7
LRP2-204	ENST00000491228	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.46	□□□□□ -1.7
LRP2-204	ENST00000491228		Q6JHZ5	121 aa		4.46	□□□□□ -1.7
LRP2-204	ENST00000491228		Q8N1X5	172 aa		4.46	□□□□□ -1.7
LRP2-204	ENST00000491228	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.46	□□□□□ -1.7
LRP2-204	ENST00000491228	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.46	□□□□□ -1.7
LRP2-204	ENST00000491228	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.46	□□□□□ -1.7

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms