RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491228.1

LRP2-204, Transcript of LDL receptor related protein 2, human

TSL 4

Gene LRP2, Length 556 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRP2-204	ENST00000491228	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		17.41	■□□□□ 0.38
LRP2-204	ENST00000491228	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	17.19	■□□□□ 0.34
LRP2-204	ENST00000491228	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
LRP2-204	ENST00000491228	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
LRP2-204	ENST00000491228	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		14.43	□□□□□ -0.1
LRP2-204	ENST00000491228	ADRA2B	P18089	450 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LRP2-204	ENST00000491228	FOXD1	Q16676	465 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LRP2-204	ENST00000491228	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LRP2-204	ENST00000491228	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LRP2-204	ENST00000491228	KCNA4	P22459	653 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LRP2-204	ENST00000491228	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		12.88	□□□□□ -0.35
LRP2-204	ENST00000491228	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
LRP2-204	ENST00000491228	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		12.76	□□□□□ -0.37
LRP2-204	ENST00000491228	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
LRP2-204	ENST00000491228	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
LRP2-204	ENST00000491228	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LRP2-204	ENST00000491228	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
LRP2-204	ENST00000491228	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
LRP2-204	ENST00000491228	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		12.3	□□□□□ -0.44
LRP2-204	ENST00000491228	MSH5	O43196	834 aa		12.2	□□□□□ -0.46
LRP2-204	ENST00000491228	ZBTB22	O15209	634 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LRP2-204	ENST00000491228	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		12	□□□□□ -0.49
LRP2-204	ENST00000491228	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LRP2-204	ENST00000491228	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LRP2-204	ENST00000491228	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
LRP2-204	ENST00000491228	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LRP2-204	ENST00000491228	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
LRP2-204	ENST00000491228	SLC4A2	P04920	1241 aa		11.54	□□□□□ -0.56
LRP2-204	ENST00000491228	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
LRP2-204	ENST00000491228	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LRP2-204	ENST00000491228	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LRP2-204	ENST00000491228	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
LRP2-204	ENST00000491228	FKBP8	Q14318	412 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LRP2-204	ENST00000491228	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
LRP2-204	ENST00000491228	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRP2-204	ENST00000491228	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LRP2-204	ENST00000491228	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LRP2-204	ENST00000491228	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
LRP2-204	ENST00000491228	SLC24A1	O60721	1099 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRP2-204	ENST00000491228	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
LRP2-204	ENST00000491228	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
LRP2-204	ENST00000491228	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
LRP2-204	ENST00000491228		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
LRP2-204	ENST00000491228	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		10.96	□□□□□ -0.65
LRP2-204	ENST00000491228	APLP2	Q06481	763 aa		10.93	□□□□□ -0.66
LRP2-204	ENST00000491228	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		10.93	□□□□□ -0.66
LRP2-204	ENST00000491228	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
LRP2-204	ENST00000491228	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
LRP2-204	ENST00000491228	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LRP2-204	ENST00000491228	FBXO3	Q9UK99	471 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LRP2-204	ENST00000491228	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		10.71	□□□□□ -0.69
LRP2-204	ENST00000491228	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		10.7	□□□□□ -0.7
LRP2-204	ENST00000491228	FBLN2	P98095	1184 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LRP2-204	ENST00000491228	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LRP2-204	ENST00000491228	PROM2	Q8N271	834 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LRP2-204	ENST00000491228	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
LRP2-204	ENST00000491228	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	10.55	□□□□□ -0.72
LRP2-204	ENST00000491228	POLA2	Q14181	598 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LRP2-204	ENST00000491228	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
LRP2-204	ENST00000491228	NACAD	O15069	1562 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LRP2-204	ENST00000491228	ABCC9	O60706	1549 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LRP2-204	ENST00000491228	CAPN15	O75808	1086 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LRP2-204	ENST00000491228	RNF39	Q9H2S5	420 aa		10.46	□□□□□ -0.73
LRP2-204	ENST00000491228	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
LRP2-204	ENST00000491228	POTED	Q86YR6	584 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LRP2-204	ENST00000491228	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LRP2-204	ENST00000491228	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LRP2-204	ENST00000491228	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
LRP2-204	ENST00000491228	SCRIB	Q14160	1630 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LRP2-204	ENST00000491228	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LRP2-204	ENST00000491228	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
LRP2-204	ENST00000491228	ABCB7	O75027	752 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LRP2-204	ENST00000491228	PKD2	Q13563	968 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LRP2-204	ENST00000491228	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LRP2-204	ENST00000491228	HRC	P23327	699 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LRP2-204	ENST00000491228	KLHL34	Q8N239	644 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LRP2-204	ENST00000491228	SPOCK2	Q92563	424 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LRP2-204	ENST00000491228	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LRP2-204	ENST00000491228	TRIM41	Q8WV44	630 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LRP2-204	ENST00000491228	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LRP2-204	ENST00000491228	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LRP2-204	ENST00000491228	SPDYE6	P0CI01	402 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LRP2-204	ENST00000491228	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LRP2-204	ENST00000491228	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LRP2-204	ENST00000491228	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LRP2-204	ENST00000491228	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
LRP2-204	ENST00000491228	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LRP2-204	ENST00000491228	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
LRP2-204	ENST00000491228	DSG3	P32926	999 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LRP2-204	ENST00000491228	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LRP2-204	ENST00000491228	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LRP2-204	ENST00000491228	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LRP2-204	ENST00000491228	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
LRP2-204	ENST00000491228	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LRP2-204	ENST00000491228	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
LRP2-204	ENST00000491228	BCAN	Q96GW7	911 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LRP2-204	ENST00000491228	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
LRP2-204	ENST00000491228	MIER1	Q8N108	512 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LRP2-204	ENST00000491228	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LRP2-204	ENST00000491228	PLEKHG5	O94827	1062 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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