RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 CXCL5P42830 114 aa10.05□□□□□ -0.8
GPC1-208ENST00000469694 HILS1P60008 231 aa10.05□□□□□ -0.8
GPC1-208ENST00000469694 HTN1P15515 57 aa10.05□□□□□ -0.8
GPC1-208ENST00000469694 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa10.04□□□□□ -0.8
GPC1-208ENST00000469694 CCL24O00175 119 aa10.04□□□□□ -0.8
GPC1-208ENST00000469694 DYNLRB2Q8TF09 96 aa10.04□□□□□ -0.8
GPC1-208ENST00000469694 PEMTQ9UBM1 199 aa10.04□□□□□ -0.8
GPC1-208ENST00000469694 TIMM17BO60830 172 aa10.04□□□□□ -0.8
GPC1-208ENST00000469694 C2orf48Q96LS8 159 aa10.04□□□□□ -0.8
GPC1-208ENST00000469694 VWFP04275 2813 aa10.04□□□□□ -0.8
GPC1-208ENST00000469694 TENM1Q9UKZ4 2725 aa10.04□□□□□ -0.8
GPC1-208ENST00000469694 RPS28P62857 69 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
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GPC1-208ENST00000469694 PRM2P04554 102 aa10.03□□□□□ -0.8
GPC1-208ENST00000469694 CRYGAP11844 174 aa10.03□□□□□ -0.8
GPC1-208ENST00000469694 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.03□□□□□ -0.8
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GPC1-208ENST00000469694 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa10.02□□□□□ -0.8
GPC1-208ENST00000469694 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
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GPC1-208ENST00000469694 NACAE9PAV3 2078 aa10.01□□□□□ -0.81
GPC1-208ENST00000469694 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
GPC1-208ENST00000469694 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa10□□□□□ -0.81
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GPC1-208ENST00000469694 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
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GPC1-208ENST00000469694 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
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GPC1-208ENST00000469694 C16orf95Q9H693 158 aa10□□□□□ -0.81
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GPC1-208ENST00000469694 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.93□□□□□ -0.82
GPC1-208ENST00000469694 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa9.93□□□□□ -0.82
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GPC1-208ENST00000469694 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.93□□□□□ -0.82
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GPC1-208ENST00000469694 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.92□□□□□ -0.82
GPC1-208ENST00000469694 Q9H8V8 135 aa9.92□□□□□ -0.82
GPC1-208ENST00000469694 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.91□□□□□ -0.82
GPC1-208ENST00000469694 A0A0U1RRA0 63 aa9.91□□□□□ -0.82
GPC1-208ENST00000469694 TMEM258P61165 79 aa9.91□□□□□ -0.82
GPC1-208ENST00000469694 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
GPC1-208ENST00000469694 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.91□□□□□ -0.82
GPC1-208ENST00000469694 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
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GPC1-208ENST00000469694 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
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GPC1-208ENST00000469694 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.87□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 OXTP01178 125 aa9.87□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 IGLV1-51P01701 117 aa9.87□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 PF4P02776 101 aa9.87□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 ZNF415Q09FC8 603 aa9.87□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 Q6ZSN1 163 aa9.87□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa9.86□□□□□ -0.83
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