RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7□□□□□ -1.29
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RABGGTB-201ENST00000319942 LELP1Q5T871 98 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00469Q8N7U9 141 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7□□□□□ -1.29
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RABGGTB-201ENST00000319942 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.99□□□□□ -1.29
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RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 J3QQQ9 107 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 CCL25O15444 150 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 RBX1P62877 108 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.98□□□□□ -1.29
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RABGGTB-201ENST00000319942 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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RABGGTB-201ENST00000319942 B9D2Q9BPU9 175 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.98□□□□□ -1.29
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RABGGTB-201ENST00000319942 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 SS18Q15532 418 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 MPV17L2Q567V2 206 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-201ENST00000319942 HSD52Q0P140 79 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-201ENST00000319942 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.95□□□□□ -1.3
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RABGGTB-201ENST00000319942 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-201ENST00000319942 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-201ENST00000319942 SPINK8P0C7L1 97 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGGTB-201ENST00000319942 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
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RABGGTB-201ENST00000319942 IGLL5B9A064 214 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM238C9JI98 176 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 GCSHP23434 173 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 CEND1Q8N111 149 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 KLK12Q9UKR0 248 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFA1O15239 70 aa6.89□□□□□ -1.31
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RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 HERV-K104P63124 156 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 C5orf38Q86SI9 138 aa6.89□□□□□ -1.31
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RABGGTB-201ENST00000319942 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 ANK2Q01484 3957 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0J9YXY3 114 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 COX7A2LO14548 114 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 MALP21145 153 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 SFTA2Q6UW10 78 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZVH6 145 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 COX7B2Q8TF08 81 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR34Q9NV39 138 aa6.88□□□□□ -1.31
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