RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270722.9

PRDM16-201, Transcript of PR/SET domain 16, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM16, Length 8,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16-201ENST00000270722 ODF3BA8MYP8 253 aa10□□□□□ -0.81
PRDM16-201ENST00000270722 DEFB4AO15263 64 aa10□□□□□ -0.81
PRDM16-201ENST00000270722 Q6YL49 198 aa10□□□□□ -0.81
PRDM16-201ENST00000270722 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa9.99□□□□□ -0.81
PRDM16-201ENST00000270722 ARTNQ5T4W7 220 aa9.99□□□□□ -0.81
PRDM16-201ENST00000270722 COX17Q14061 63 aa9.99□□□□□ -0.81
PRDM16-201ENST00000270722 BCE1O60756 84 aa9.98□□□□□ -0.81
PRDM16-201ENST00000270722 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.98□□□□□ -0.81
PRDM16-201ENST00000270722 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRDM16-201ENST00000270722 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa9.97□□□□□ -0.81
PRDM16-201ENST00000270722 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PRDM16-201ENST00000270722 Q6ZQY7 126 aa9.97□□□□□ -0.81
PRDM16-201ENST00000270722 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.96□□□□□ -0.81
PRDM16-201ENST00000270722 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.96□□□□□ -0.81
PRDM16-201ENST00000270722 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.96□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 LY6LH3BQJ8 138 aa9.96□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa9.95□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa9.95□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.95□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 LINC00208Q96KT6 92 aa9.95□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.94□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.94□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.94□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 M0R378 163 aa9.94□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 LELP1Q5T871 98 aa9.94□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.94□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 K7EQG2 157 aa9.93□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 C7orf65Q6ZTY9 151 aa9.93□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.93□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 INAFM1C9JVW0 142 aa9.92□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 LY6G6CO95867 125 aa9.92□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa9.92□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 WIPF1O43516 503 aa9.92□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.92□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.92□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 COL4A1P02462 1669 aa9.91□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.91□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 Q6ZTI0 123 aa9.91□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 Q6ZVQ6 151 aa9.91□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 Q8N7P7 452 aa9.91□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 A0A096LNI7 61 aa9.91□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 C10orf25Q5T742 122 aa9.9□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.9□□□□□ -0.82
PRDM16-201ENST00000270722 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 LMO4P61968 165 aa9.89□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 Q6ZSR3 168 aa9.89□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.89□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 LCA10Q71F78 164 aa9.89□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.89□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 A0A1B0GXF2 115 aa9.88□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.88□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.88□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.88□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.87□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa9.87□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.87□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 PATE2Q6UY27 113 aa9.86□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 A0A0J9YWU9 116 aa9.85□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 PRAC2D3DTV9 90 aa9.85□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 A0A1B0GU69 56 aa9.85□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 C3orf84H3BNL1 204 aa9.85□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 P0C879 139 aa9.85□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 HCG22E2RYF7 251 aa9.84□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 ERC2-IT1O76042 136 aa9.84□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa9.84□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 PCSK5Q92824 1860 aa9.84□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PRDM16-201ENST00000270722 C22orf34Q6ZV56 151 aa9.83□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 Q8N3U1 123 aa9.83□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 Q6ZSV7 163 aa9.83□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 PRR15Q8IV56 129 aa9.83□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 LY6G6DO95868 133 aa9.82□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 ZNF843Q8N446 348 aa9.82□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 RITA1Q96K30 269 aa9.82□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 U3KQK5 164 aa9.82□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.81□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.81□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 MAST4O15021 2626 aa9.81□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.81□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 C6orf99Q4VX62 202 aa9.81□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 H0Y9P7 68 aa9.8□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.8□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 H3BS24 57 aa9.8□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 Q8NA96 180 aa9.79□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.79□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.78□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 COL4A6Q14031 1691 aa9.78□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 Q8IZM0 81 aa9.78□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.78□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.78□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 IGKV2D-28P01615 120 aa9.78□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.78□□□□□ -0.84
PRDM16-201ENST00000270722 M0QY20 66 aa9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.8 ms