RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 RETNQ9HD89 108 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF815PA8K554 130 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 K7EIL1 84 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 SPATA25Q9BR10 227 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 TM2D2Q9BX73 214 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A0J9YY99 117 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A096LPF7 62 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1B0GV90 55 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 CCL25O15444 150 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 RBX1P62877 108 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 COX6A2Q02221 97 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 LELP1Q5T871 98 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC1-201ENST00000229304 A6NDN8 102 aa6.58□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.58□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.58□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 CEND1Q8N111 149 aa6.58□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A0J9YWU9 116 aa6.57□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM262E9PQX1 116 aa6.57□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 SPINK8P0C7L1 97 aa6.57□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 HTN3P15516 51 aa6.57□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.57□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.57□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.57□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.57□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.56□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.56□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 TAX1BP3O14907 124 aa6.56□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 GCSHP23434 173 aa6.56□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 FXYD2P54710 66 aa6.56□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 Q6ZTC4 211 aa6.56□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.56□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.56□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 HIST1H4GQ99525 98 aa6.56□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.56□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.55□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 NOTCH1P46531 2555 aa6.55□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.55□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.55□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.55□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 TIMM17BO60830 172 aa6.55□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.55□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 COX11Q9Y6N1 276 aa6.55□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A087WZ39 114 aa6.54□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A0J9YXY3 114 aa6.54□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1B0GWB2 263 aa6.54□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 NDUFA1O15239 70 aa6.54□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 PTTG1IPP53801 180 aa6.54□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 SS18Q15532 418 aa6.54□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.54□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 Q6ZVH6 145 aa6.54□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM238C9JI98 176 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 IGHV3-30P01768 117 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 SMIM13P0DJ93 91 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC1-201ENST00000229304 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.52□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 HERV-K104P63124 156 aa6.52□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 LITAFQ99732 161 aa6.52□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.52□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 SPANXCQ9NY87 97 aa6.52□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 C9orf118A6NHY6 69 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 K7EP13 123 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 REG3AQ06141 175 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 SFTA2Q6UW10 78 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 MRAPQ8TCY5 172 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 PRR34Q9NV39 138 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 B9D2Q9BPU9 175 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 Q9H8V8 135 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 IFITM1P13164 125 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
APOBEC1-201ENST00000229304 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms