RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm9Q3UKW5 162 aa14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp273Q7M6W8 501 aa14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr965Q7TRA7 312 aa14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gphb5Q812B2 130 aa14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm9837Q8C607 126 aa14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Shisa2Q8QZV2 295 aa14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr368Q8VF22 327 aa14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem51Q99LG1 249 aa14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vmn1r46Q9EQ45 309 aa14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wrap73Q9JM98 462 aa14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm6993A0A1W2P738 69 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr267A2AM35 313 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm12790B1AUV6 201 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc25a4P48962 298 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Npy1rQ04573 382 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc25a39Q9D8K8 359 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Samt1A2BED8 237 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp764E9QAP1 431 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm5458L7N219 204 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm6871L7N248 545 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Reg3gO09049 174 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gata2O09100 480 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prkar2aP12367 401 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fgf7P36363 194 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cdx4Q07424 282 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rab14Q91V41 215 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cma2Q91VB1 246 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PpifQ99KR7 206 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ighv1-80A0A075B5Y3 117 aa14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Frrs1lB1AXV0 293 aa14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 P01741 114 aa14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Adat3Q6PAT0 349 aa14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr1382Q7TQT3 311 aa14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Smco3Q8BQM7 225 aa14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 FuomQ8R2K1 153 aa14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr127Q8VF25 323 aa14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Necap2Q9D1J1 266 aa14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hey1Q9WV93 299 aa14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam98cE9PYD1 344 aa14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hmgb3O54879 200 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Syngr2O55101 224 aa14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 P01790 122 aa14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PipP02816 146 aa14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr477Q8VGI6 310 aa14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Glo1Q9CPU0 184 aa14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rpl11Q9CXW4 178 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Igkv4-57-1A0A075B5M4 119 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trav9-2A0A075B647 113 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm8797A0A0A6YW67 77 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trav9-4A0A0B4J1K2 113 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmsb15aA2AEH9 79 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm2026A2ART4 498 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ly6g6fB2RXM6 300 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rps10P63325 165 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rbm38Q62176 237 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc50a1Q9CXK4 221 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem190Q9D2E9 166 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Klk11Q9QYN3 276 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bub3Q9WVA3 326 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trbv30A0A0B4J1P1 111 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trbv17A0A140T8P8 114 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Esp8F7AMQ8 149 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rhox4fQ2MDF8 205 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rhox4cQ2MDG1 205 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr1168Q7TR25 312 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr335-psQ7TRY6 312 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Q8BN57 294 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr206Q8VGP9 306 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rhox4aQ9D3I8 205 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lsm4Q9QXA5 137 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm28285A0A087WQ54 102 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AU041133A0A0J9YVH3 498 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm10638F6QEG2 257 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Phxr5P08399 672 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ap2s1P62743 142 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc2a9Q3T9X0 538 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pafah1b2Q61206 229 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr138Q7TRI7 312 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eda2rQ8BX35 297 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Stxbp6Q8R3T5 210 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 TecrQ9CY27 308 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tsga8Q9JJL0 238 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tsc22d3Q9Z2S7 137 aa14.64□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hbb-bh2B2RVB7 147 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr204E9Q8M0 305 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr263Q7TQT8 317 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr512Q8VFZ4 326 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr639Q8VGY8 316 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PpbpQ9EQI5 113 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tnfrsf13bQ9ET35 249 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf740Q6NZQ6 180 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rbfox3Q8BIF2 374 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dusp18Q8VE01 188 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 EpcamQ99JW5 315 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tnfrsf23Q9ER63 176 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ap4m1Q9JKC7 449 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kmt2aP55200 3966 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trav17A0A075B655 113 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Igkv4-59A0A0B4J1I8 117 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 SelenotP62342 195 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 108.7 ms