Protein–RNA interactions for Protein: P62342

Selenot, Thioredoxin reductase-like selenoprotein T, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenotP62342 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SelenotP62342 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SelenotP62342 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SelenotP62342 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SelenotP62342 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SelenotP62342 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SelenotP62342 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SelenotP62342 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SelenotP62342 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SelenotP62342 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SelenotP62342 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SelenotP62342 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SelenotP62342 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SelenotP62342 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SelenotP62342 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SelenotP62342 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SelenotP62342 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SelenotP62342 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SelenotP62342 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SelenotP62342 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SelenotP62342 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SelenotP62342 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SelenotP62342 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SelenotP62342 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SelenotP62342 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SelenotP62342 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelenotP62342 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SelenotP62342 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SelenotP62342 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelenotP62342 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SelenotP62342 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SelenotP62342 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SelenotP62342 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SelenotP62342 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SelenotP62342 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SelenotP62342 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SelenotP62342 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SelenotP62342 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SelenotP62342 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SelenotP62342 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SelenotP62342 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SelenotP62342 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SelenotP62342 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SelenotP62342 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelenotP62342 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SelenotP62342 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SelenotP62342 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SelenotP62342 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SelenotP62342 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SelenotP62342 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SelenotP62342 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelenotP62342 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelenotP62342 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenotP62342 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SelenotP62342 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SelenotP62342 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SelenotP62342 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SelenotP62342 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SelenotP62342 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SelenotP62342 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SelenotP62342 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SelenotP62342 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SelenotP62342 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SelenotP62342 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SelenotP62342 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SelenotP62342 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SelenotP62342 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SelenotP62342 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelenotP62342 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SelenotP62342 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SelenotP62342 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SelenotP62342 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SelenotP62342 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SelenotP62342 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SelenotP62342 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SelenotP62342 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SelenotP62342 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SelenotP62342 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SelenotP62342 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelenotP62342 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelenotP62342 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SelenotP62342 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SelenotP62342 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SelenotP62342 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SelenotP62342 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SelenotP62342 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenotP62342 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenotP62342 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelenotP62342 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelenotP62342 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelenotP62342 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SelenotP62342 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SelenotP62342 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SelenotP62342 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SelenotP62342 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SelenotP62342 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SelenotP62342 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SelenotP62342 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SelenotP62342 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SelenotP62342 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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