Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Ap4m1Q9JKC7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ap4m1Q9JKC7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ap4m1Q9JKC7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Ap4m1Q9JKC7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Ap4m1Q9JKC7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ap4m1Q9JKC7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,52■■□□□ 1,84
Ap4m1Q9JKC7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ap4m1Q9JKC7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Ap4m1Q9JKC7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ap4m1Q9JKC7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Ap4m1Q9JKC7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ap4m1Q9JKC7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ap4m1Q9JKC7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Ap4m1Q9JKC7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ap4m1Q9JKC7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ap4m1Q9JKC7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ap4m1Q9JKC7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ap4m1Q9JKC7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Ap4m1Q9JKC7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
Ap4m1Q9JKC7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Ap4m1Q9JKC7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Ap4m1Q9JKC7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Ap4m1Q9JKC7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Ap4m1Q9JKC7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Ap4m1Q9JKC7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,6■■□□□ 1,53
Ap4m1Q9JKC7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Ap4m1Q9JKC7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Ap4m1Q9JKC7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Ap4m1Q9JKC7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Ap4m1Q9JKC7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Ap4m1Q9JKC7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Ap4m1Q9JKC7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Ap4m1Q9JKC7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,17■■□□□ 1,46
Ap4m1Q9JKC7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Ap4m1Q9JKC7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Ap4m1Q9JKC7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Ap4m1Q9JKC7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Ap4m1Q9JKC7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Ap4m1Q9JKC7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Ap4m1Q9JKC7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Ap4m1Q9JKC7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Ap4m1Q9JKC7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,95■■□□□ 1,42
Ap4m1Q9JKC7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Ap4m1Q9JKC7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Ap4m1Q9JKC7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,92■■□□□ 1,42
Ap4m1Q9JKC7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ap4m1Q9JKC7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,75■■□□□ 1,39
Ap4m1Q9JKC7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Ap4m1Q9JKC7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ap4m1Q9JKC7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Ap4m1Q9JKC7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Ap4m1Q9JKC7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ap4m1Q9JKC7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ap4m1Q9JKC7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Ap4m1Q9JKC7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
Ap4m1Q9JKC7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Ap4m1Q9JKC7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Ap4m1Q9JKC7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Ap4m1Q9JKC7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Ap4m1Q9JKC7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Ap4m1Q9JKC7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ap4m1Q9JKC7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ap4m1Q9JKC7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Ap4m1Q9JKC7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Ap4m1Q9JKC7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Ap4m1Q9JKC7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ap4m1Q9JKC7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Ap4m1Q9JKC7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ap4m1Q9JKC7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Ap4m1Q9JKC7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Ap4m1Q9JKC7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Ap4m1Q9JKC7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Ap4m1Q9JKC7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ap4m1Q9JKC7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ap4m1Q9JKC7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,21■■□□□ 1,31
Ap4m1Q9JKC7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ap4m1Q9JKC7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ap4m1Q9JKC7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ap4m1Q9JKC7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ap4m1Q9JKC7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ap4m1Q9JKC7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ap4m1Q9JKC7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ap4m1Q9JKC7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ap4m1Q9JKC7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ap4m1Q9JKC7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ap4m1Q9JKC7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ap4m1Q9JKC7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ap4m1Q9JKC7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ap4m1Q9JKC7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ap4m1Q9JKC7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
Ap4m1Q9JKC7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Ap4m1Q9JKC7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ap4m1Q9JKC7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ap4m1Q9JKC7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,23
Ap4m1Q9JKC7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Ap4m1Q9JKC7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Ap4m1Q9JKC7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,63■■□□□ 1,21
Ap4m1Q9JKC7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms