Protein–RNA interactions for Protein: P02816

Pip, Prolactin-inducible protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PipP02816 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
PipP02816 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
PipP02816 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
PipP02816 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
PipP02816 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,2■■□□□ 1,94
PipP02816 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
PipP02816 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,07■■□□□ 1,76
PipP02816 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
PipP02816 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
PipP02816 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
PipP02816 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
PipP02816 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
PipP02816 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
PipP02816 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
PipP02816 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
PipP02816 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
PipP02816 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,46■■□□□ 1,67
PipP02816 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
PipP02816 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
PipP02816 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
PipP02816 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
PipP02816 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
PipP02816 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
PipP02816 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
PipP02816 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
PipP02816 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
PipP02816 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
PipP02816 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
PipP02816 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
PipP02816 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,52
PipP02816 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
PipP02816 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
PipP02816 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
PipP02816 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
PipP02816 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
PipP02816 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
PipP02816 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
PipP02816 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
PipP02816 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
PipP02816 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
PipP02816 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,07■■□□□ 1,44
PipP02816 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
PipP02816 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
PipP02816 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,98■■□□□ 1,43
PipP02816 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,96■■□□□ 1,43
PipP02816 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,92■■□□□ 1,42
PipP02816 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
PipP02816 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
PipP02816 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
PipP02816 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,77■■□□□ 1,4
PipP02816 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
PipP02816 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,75■■□□□ 1,39
PipP02816 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
PipP02816 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,69■■□□□ 1,38
PipP02816 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
PipP02816 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,62■■□□□ 1,37
PipP02816 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
PipP02816 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,59■■□□□ 1,37
PipP02816 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
PipP02816 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
PipP02816 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
PipP02816 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
PipP02816 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
PipP02816 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
PipP02816 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
PipP02816 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
PipP02816 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
PipP02816 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,38■■□□□ 1,33
PipP02816 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
PipP02816 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
PipP02816 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
PipP02816 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
PipP02816 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
PipP02816 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
PipP02816 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
PipP02816 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
PipP02816 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,26■■□□□ 1,31
PipP02816 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,21■■□□□ 1,31
PipP02816 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
PipP02816 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
PipP02816 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
PipP02816 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,29
PipP02816 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
PipP02816 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
PipP02816 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
PipP02816 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
PipP02816 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
PipP02816 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
PipP02816 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
PipP02816 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
PipP02816 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,27
PipP02816 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
PipP02816 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
PipP02816 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
PipP02816 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,84■■□□□ 1,25
PipP02816 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
PipP02816 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
PipP02816 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
PipP02816 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
PipP02816 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,74■■□□□ 1,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms