RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 EppinQ9DA01 134 aa15.64■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 1700008P02RikQ9DAJ8 175 aa15.64■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rab9aQ9R0M6 201 aa15.64■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ighv3-4A0A0A6YXF1 117 aa15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Crebl2Q32M00 123 aa15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kcnip4Q6PHZ8 250 aa15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eda2rQ8BX35 297 aa15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SpartQ8R1X6 671 aa15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Polr3kQ9CQZ7 108 aa15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q9D8L0 127 aa15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Arpc1aQ9R0Q6 370 aa15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AcanQ61282 2132 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lynx1P0DP60 116 aa15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Phxr2P15972 65 aa15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr15P23275 312 aa15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 HrkP62816 92 aa15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slamf7Q8BHK6 333 aa15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm4763Q8CFJ5 196 aa15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr435Q8VFS3 313 aa15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ctnnbip1Q9JJN6 81 aa15.63■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Igkv4-57A0A0A6YYE7 117 aa15.62■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm5239D3YYZ2 122 aa15.62■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Thap8E9Q695 213 aa15.62■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ube2e1P52482 193 aa15.62■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trav15-1-dv6-1Q5R1D2 117 aa15.62■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trp53rkaQ5U452 244 aa15.62■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cldn16Q925N4 235 aa15.62■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tp53rkQ99PW4 244 aa15.62■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pf4Q9Z126 105 aa15.62■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem29A2ANF5 204 aa15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P01724 129 aa15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hoxa5P09021 270 aa15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gpm6bP35803 328 aa15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Defb30Q30KN4 75 aa15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adat3Q6PAT0 349 aa15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr509Q8VF20 321 aa15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CklfQ9DAS1 152 aa15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Med12A2AGH6 2190 aa15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1326-ps1A0A140T8J7 311 aa15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tm4sf19E9Q9H8 206 aa15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm27021M0QWE2 156 aa15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mamld1P0C6A2 803 aa15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Meox2P32443 303 aa15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Acaa1aQ921H8 424 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Higd1bQ99JY6 98 aa15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cxcr6Q9EQ16 351 aa15.61■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mettl23A2AA28 253 aa15.6■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm5741B2RVA4 72 aa15.6■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr872E9PVW2 323 aa15.6■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Edn3P48299 214 aa15.6■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Crip1P63254 77 aa15.6■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm9733Q1AN91 178 aa15.6■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pilrb2Q2YFS1 225 aa15.6■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q497N7 227 aa15.6■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1030Q8VFL5 318 aa15.6■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1413Q8VGU3 323 aa15.6■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ighv1-15A0A0A6YXA5 117 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trav23A0A0G2JG17 115 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1191-ps1A0A1L1STD5 311 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm21834J3QN05 151 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccl1P10146 92 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MgpP19788 104 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Plp1P60202 277 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RanP62827 216 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr433Q7TRV9 314 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gng5Q80SZ7 68 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm5468Q8C3D3 155 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Habp2Q8K0D2 558 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tbx19Q99ME7 446 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lelp1Q9DAE3 120 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pard6aQ9Z101 346 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 OtoglF7A4A7 2325 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ighv6-3A0A075B5T2 118 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 V1rd19Q3KNP5 305 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfand3Q497H0 227 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm10334Q792Y8 246 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RpeQ8VEE0 228 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pdzd11Q9CZG9 140 aa15.59■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rnase9P60154 184 aa15.58■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q8CF25 301 aa15.58■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trappc2lQ9JME7 139 aa15.58■□□□□ 0.09
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Svep1A2AVA0 3567 aa15.58■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1118A0A0J9YUE7 307 aa15.58■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rnf212bD3Z423 297 aa15.58■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NdnP25233 325 aa15.58■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam168aQ8BGZ2 244 aa15.58■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr262Q8VFV8 312 aa15.58■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psg18B2RSG7 476 aa15.57■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm21900J3QP38 180 aa15.57■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adcyap1O70176 175 aa15.57■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cldn1O88551 211 aa15.57■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdx1P18111 268 aa15.57■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fabp6P51162 128 aa15.57■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf474Q6V5K9 347 aa15.57■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Oraov1Q8CH62 137 aa15.57■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rgs13Q8K443 158 aa15.57■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gatad1Q920S3 266 aa15.57■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1537P34983 314 aa15.56■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wfdc9Q3UW41 83 aa15.56■□□□□ 0.08
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Btf3Q64152 204 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.4 ms