Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
V1rd19Q3KNP5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
V1rd19Q3KNP5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
V1rd19Q3KNP5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
V1rd19Q3KNP5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
V1rd19Q3KNP5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
V1rd19Q3KNP5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
V1rd19Q3KNP5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
V1rd19Q3KNP5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,46■■□□□ 1,51
V1rd19Q3KNP5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
V1rd19Q3KNP5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
V1rd19Q3KNP5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
V1rd19Q3KNP5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
V1rd19Q3KNP5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,98■■□□□ 1,43
V1rd19Q3KNP5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,98■■□□□ 1,43
V1rd19Q3KNP5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
V1rd19Q3KNP5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
V1rd19Q3KNP5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
V1rd19Q3KNP5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
V1rd19Q3KNP5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
V1rd19Q3KNP5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
V1rd19Q3KNP5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
V1rd19Q3KNP5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
V1rd19Q3KNP5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
V1rd19Q3KNP5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,34■■□□□ 1,33
V1rd19Q3KNP5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
V1rd19Q3KNP5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
V1rd19Q3KNP5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
V1rd19Q3KNP5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,24■■□□□ 1,31
V1rd19Q3KNP5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
V1rd19Q3KNP5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
V1rd19Q3KNP5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,11■■□□□ 1,29
V1rd19Q3KNP5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
V1rd19Q3KNP5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
V1rd19Q3KNP5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
V1rd19Q3KNP5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
V1rd19Q3KNP5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,92■■□□□ 1,26
V1rd19Q3KNP5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,88■■□□□ 1,25
V1rd19Q3KNP5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
V1rd19Q3KNP5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
V1rd19Q3KNP5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
V1rd19Q3KNP5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,72■■□□□ 1,23
V1rd19Q3KNP5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
V1rd19Q3KNP5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,71■■□□□ 1,23
V1rd19Q3KNP5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
V1rd19Q3KNP5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
V1rd19Q3KNP5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
V1rd19Q3KNP5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
V1rd19Q3KNP5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,48■■□□□ 1,19
V1rd19Q3KNP5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
V1rd19Q3KNP5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,41■■□□□ 1,18
V1rd19Q3KNP5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,37■■□□□ 1,17
V1rd19Q3KNP5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
V1rd19Q3KNP5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,21■■□□□ 1,15
V1rd19Q3KNP5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
V1rd19Q3KNP5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
V1rd19Q3KNP5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,13■■□□□ 1,13
V1rd19Q3KNP5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
V1rd19Q3KNP5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
V1rd19Q3KNP5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,07■■□□□ 1,12
V1rd19Q3KNP5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
V1rd19Q3KNP5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
V1rd19Q3KNP5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
V1rd19Q3KNP5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
V1rd19Q3KNP5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1,11
V1rd19Q3KNP5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
V1rd19Q3KNP5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
V1rd19Q3KNP5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
V1rd19Q3KNP5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
V1rd19Q3KNP5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
V1rd19Q3KNP5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,91■■□□□ 1,1
V1rd19Q3KNP5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,88■■□□□ 1,09
V1rd19Q3KNP5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,81■■□□□ 1,08
V1rd19Q3KNP5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
V1rd19Q3KNP5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
V1rd19Q3KNP5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
V1rd19Q3KNP5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
V1rd19Q3KNP5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
V1rd19Q3KNP5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
V1rd19Q3KNP5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
V1rd19Q3KNP5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
V1rd19Q3KNP5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
V1rd19Q3KNP5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21,57■■□□□ 1,04
V1rd19Q3KNP5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
V1rd19Q3KNP5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
V1rd19Q3KNP5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,51■■□□□ 1,03
V1rd19Q3KNP5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
V1rd19Q3KNP5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
V1rd19Q3KNP5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
V1rd19Q3KNP5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
V1rd19Q3KNP5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
V1rd19Q3KNP5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
V1rd19Q3KNP5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
V1rd19Q3KNP5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
V1rd19Q3KNP5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
V1rd19Q3KNP5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
V1rd19Q3KNP5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
V1rd19Q3KNP5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
V1rd19Q3KNP5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
V1rd19Q3KNP5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,9 ms