RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636022.1

CACNA1A-222, Transcript of calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A, human

TSL 3

Gene CACNA1A, Length 552 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNA1A-222	ENST00000636022	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	STPG4	Q8N801	248 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	TNXB	P22105	4242 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022		F5H697	171 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022		M0QY20	66 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	CRP	P02741	224 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	MIA	Q16674	131 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	PRSS1	P07477	247 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	CTRL	P40313	264 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	GNG4	P50150	75 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	CACNG7	P62955	275 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	GAGE6	Q13070	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022		F2Z2F3	143 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	PDE6D	O43924	150 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	HERV-K104	P63124	156 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNA1A-222	ENST00000636022		A0A1B0GUV1	79 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022		A4D1N5	150 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022		H7C1H1	209 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022		P01737	135 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	MGP	P08493	103 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	BCL2	P10415	239 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	NTF3	P20783	257 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	REG3A	Q06141	175 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	PANO1	I0J062	215 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022		K7EN84	100 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	IFNA1	P01562	189 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	ESD	P10768	282 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	CKS1B	P61024	79 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNA1A-222	ENST00000636022	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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