RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-205ENST00000577827 CDK2AP2O75956 126 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-205ENST00000577827 NDUFC2O95298 119 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-205ENST00000577827 C5orf47Q569G3 176 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-205ENST00000577827 UPK3BQ9BT76 320 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-205ENST00000577827 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-205ENST00000577827 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.64□□□□□ -1.19
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PTPRM-205ENST00000577827 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.64□□□□□ -1.19
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PTPRM-205ENST00000577827 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.64□□□□□ -1.19
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PTPRM-205ENST00000577827 A8MZ25 164 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRM-205ENST00000577827 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRM-205ENST00000577827 C20orf197Q8N268 126 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRM-205ENST00000577827 FAM236CP0DP71 79 aa7.62□□□□□ -1.19
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PTPRM-205ENST00000577827 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-205ENST00000577827 CCKP06307 115 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-205ENST00000577827 DEFB135Q30KP9 77 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-205ENST00000577827 ESM1Q9NQ30 184 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-205ENST00000577827 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00315P59091 139 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 HIVEP2P31629 2446 aa7.51□□□□□ -1.21
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